Los cerdos Ningxiang, un tipo de cerdo de grasa, son nativos del condado de Ningxiang en la provincia de Hunan, con miles de años de historia de cría. Este estudio tiene como objetivo explorar los perfiles de expresión y las redes funcionales de los ARN mensajeros (ARNm) y los ARN largos no codificantes (ARNlnc) en el hígado. Se recolectó tejido hepático de lechones Ningxiang a los 30, 90, 150 y 210 días después del nacimiento (cuatro etapas de desarrollo), y se perfiló la expresión de ARNm y ARNlnc. En comparación con los perfiles de expresión de ARNm y ARNlnc, la mayoría de los ARNm diferencialmente expresados (DEmRNAs) se reguló al alza a los 30 días; sin embargo, la mayoría de los DElncRNAs se reguló a la baja a los 210 días. A través del análisis de Miner de Expresión de Series Temporales Cortas (STEM) y el análisis de red de coexpresión de genes ponderados (WGCNA), se identificó una interacción compleja entre ARNm y ARNlnc, lo que indica que los ARNlnc pueden ser un elemento regulador crítico para los ARNm. Un módulo de genes en particular (perfil de módulo 4) estaba relacionado con la organización de fibrillas, la vasculogénesis, la actividad de activador de GTPasa y la regulación de la actividad de quinasas. Los ARNm y ARNlnc en el perfil de módulo 4 tenían un patrón de expresión similar, lo que indica que tienen relaciones funcionales y regulatorias. Solo , , y en el perfil de ARNm 4 eran los genes objetivo de los ARNlnc en ese perfil, lo que muestra la posible relación reguladora entre los ARNlnc y los ARNm. La expresión de estos genes y ARNlnc en el perfil 4 fue la más alta a los 30 días, y se cree que estos ARN pueden desempeñar un papel crítico durante el período de lactancia para satisfacer los requerimientos dietéticos de los lechones. En la red de coexpresión de ARNlnc-ARNm, se mostró que los núcleos de genes identificados y los ARNlnc asociados estaban involucrados en el metabolismo de sacáridos, lípidos y glucosa, lo que puede desempeñar un papel importante en el desarrollo y la salud del hígado. Este resultado llevará a una investigación más profunda de las funciones de los ARNlnc hepáticos en diversas etapas de desarrollo en los cerdos Ningxiang.