Análisis del genoma completo y perfilado de la expresión de genes bajo estrés salino
Autores: Zaynab, Madiha; Sharif, Yasir; Xu, Zhaoshi; Fiaz, Sajid; Al-Yahyai, Rashid; Yadikar, Hamad. A.; Al Kashgry, Najla Amin T.; Qari, Sameer H.; Sadder, Monther; Li, Shuangfei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis del genoma completo y perfilado de la expresión de genes bajo estrés salino
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Gen
Estrés
Análisis
Genes
Expresión
Estrés salino
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
El gen desempeña un papel crítico en la mitigación del impacto de factores de estrés abiótico. En este estudio, identificamos 30 genes en un genoma de soja, distribuidos en quince cromosomas. El análisis filogenético clasificó los genes en tres grupos (grupo I, grupo II y grupo III). Curiosamente, el análisis de la estructura de los genes ilustró que varios genes no tenían intrones. Además, los resultados de la localización subcelular sugirieron que las proteínas GmDUF668 estaban presentes en el núcleo, las mitocondrias, el citoplasma y la membrana plasmática. Los promotores se analizaron in silico para obtener información sobre la presencia de secuencias regulatorias para la unión de factores de transcripción. El perfil de expresión ilustró que los genes mostraron expresión en hojas, raíces, nódulos y flores. Para investigar su respuesta al estrés salino, utilizamos los datos de secuenciación de ARN de los genes. Los resultados revelaron que los genes estaban regulados al alza frente al tratamiento de estrés salino. Además, validamos estos hallazgos utilizando análisis de qRT-PCR. Estos hallazgos proporcionan una base científica para explorar las funciones de los genes frente a diferentes condiciones de estrés.
Descripción
El gen desempeña un papel crítico en la mitigación del impacto de factores de estrés abiótico. En este estudio, identificamos 30 genes en un genoma de soja, distribuidos en quince cromosomas. El análisis filogenético clasificó los genes en tres grupos (grupo I, grupo II y grupo III). Curiosamente, el análisis de la estructura de los genes ilustró que varios genes no tenían intrones. Además, los resultados de la localización subcelular sugirieron que las proteínas GmDUF668 estaban presentes en el núcleo, las mitocondrias, el citoplasma y la membrana plasmática. Los promotores se analizaron in silico para obtener información sobre la presencia de secuencias regulatorias para la unión de factores de transcripción. El perfil de expresión ilustró que los genes mostraron expresión en hojas, raíces, nódulos y flores. Para investigar su respuesta al estrés salino, utilizamos los datos de secuenciación de ARN de los genes. Los resultados revelaron que los genes estaban regulados al alza frente al tratamiento de estrés salino. Además, validamos estos hallazgos utilizando análisis de qRT-PCR. Estos hallazgos proporcionan una base científica para explorar las funciones de los genes frente a diferentes condiciones de estrés.