Análisis del genoma completo de la familia en pollo: caracterización y perfil de expresión
Autores: Ling, Xuanze; Wang, Qifan; Zhang, Jin; Zhang, Genxi
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis del genoma completo de la familia en pollo: caracterización y perfil de expresión
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Factor similar a kruppel
Motivos de dedo de zinc
Factores de transcripción
Familia de genes
Genes de pollo
RNA-seq
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes del factor kruppel-like es un grupo de factores de transcripción que contienen motivos de dedo de zinc altamente conservados, los cuales juegan un papel crucial en la proliferación y diferenciación celular. El pollo ha sido ampliamente utilizado como un modelo animal para analizar la función de los genes; sin embargo, se sabe poco sobre la función de la familia de genes en los pollos. En este estudio, realizamos estudios a nivel genómico de los genes de pollo y analizamos sus características biológicas y de expresión. Identificamos 13 genes de pollos. Nuestras análisis filogenéticas, de motivos y de dominios conservados indican que la familia de genes se ha mantenido conservada a lo largo de la evolución. El análisis de sinonimia mostró la relación colineal entre los genes, lo que indicó que tenían funciones biomoleculares relacionadas. El análisis de redes de interacción reveló que los genes trabajaron con 20 genes en procesos biológicos. El análisis de la vía de la Enciclopedia de Kyoto de Genes y Genomas (KEGG) mostró que estaba involucrado en las vías de señalización de Apelina y Forkhead Box O (FOXO). Además, el qPCR mostró que 13 genes se expresaron en los nueve tejidos seleccionados y mostraron varios patrones de expresión génica en pollos. El RNA-seq mostró que los genes estaban expresados diferencialmente en los grupos alimentados con dieta normal y alta en grasas, y que los genes estaban expresados diferencialmente entre los preadipocitos de pollo no diferenciados y diferenciados. Además, el RNA-seq también mostró que los genes mostraron diferentes patrones de expresión en el músculo a los 11 y 16 días embrionarios, y en pollos de un día de edad. Estos resultados indicaron que los genes estaban involucrados en el desarrollo del músculo y la grasa en los pollos. Nuestros hallazgos proporcionan algunos puntos de referencia valiosos para el estudio posterior de la función de los genes.
Descripción
La familia de genes del factor kruppel-like es un grupo de factores de transcripción que contienen motivos de dedo de zinc altamente conservados, los cuales juegan un papel crucial en la proliferación y diferenciación celular. El pollo ha sido ampliamente utilizado como un modelo animal para analizar la función de los genes; sin embargo, se sabe poco sobre la función de la familia de genes en los pollos. En este estudio, realizamos estudios a nivel genómico de los genes de pollo y analizamos sus características biológicas y de expresión. Identificamos 13 genes de pollos. Nuestras análisis filogenéticas, de motivos y de dominios conservados indican que la familia de genes se ha mantenido conservada a lo largo de la evolución. El análisis de sinonimia mostró la relación colineal entre los genes, lo que indicó que tenían funciones biomoleculares relacionadas. El análisis de redes de interacción reveló que los genes trabajaron con 20 genes en procesos biológicos. El análisis de la vía de la Enciclopedia de Kyoto de Genes y Genomas (KEGG) mostró que estaba involucrado en las vías de señalización de Apelina y Forkhead Box O (FOXO). Además, el qPCR mostró que 13 genes se expresaron en los nueve tejidos seleccionados y mostraron varios patrones de expresión génica en pollos. El RNA-seq mostró que los genes estaban expresados diferencialmente en los grupos alimentados con dieta normal y alta en grasas, y que los genes estaban expresados diferencialmente entre los preadipocitos de pollo no diferenciados y diferenciados. Además, el RNA-seq también mostró que los genes mostraron diferentes patrones de expresión en el músculo a los 11 y 16 días embrionarios, y en pollos de un día de edad. Estos resultados indicaron que los genes estaban involucrados en el desarrollo del músculo y la grasa en los pollos. Nuestros hallazgos proporcionan algunos puntos de referencia valiosos para el estudio posterior de la función de los genes.