La poda es una medida agronómica importante en la gestión de plantaciones de té. En este estudio, analizamos el efecto de la poda en la expresión génica en las hojas de té desde una perspectiva transcriptómica y verificamos los resultados de un análisis transcriptómico en términos de cambios en los indicadores fisiológicos de las hojas de té. Los resultados mostraron que la poda mejoró la expresión génica de nueve vías metabólicas en las hojas de té, incluyendo la síntesis de ácidos grasos y el metabolismo de carbohidratos, el metabolismo del nitrógeno, el procesamiento de proteínas en el retículo endoplásmico y la transducción de señales de hormonas vegetales, promoviendo así el crecimiento de las plantas de té y aumentando el rendimiento del té. Sin embargo, la poda redujo la expresión génica de nueve vías metabólicas, incluyendo la biosíntesis de metabolitos secundarios, la biosíntesis de flavonoides, la biosíntesis de fenilpropanoides y la biosíntesis de sesquiterpenos y triterpenos, y disminuyó el contenido de cafeína, flavonoides y aminoácidos libres en las hojas de la planta de té. En conclusión, la poda podría promover el crecimiento de las plantas de té y aumentar el rendimiento del té, pero no fue favorable para la acumulación de algunos indicadores de calidad en las hojas de té, especialmente cafeína, flavonoides y aminoácidos libres, lo que, a su vez, redujo la calidad del té. Este estudio proporciona una referencia teórica importante para la gestión de medidas agronómicas en plantaciones de té.