Los parámetros micromorfo-métricos óseos se analizan generalmente con micro CT para revelar estructuras bidimensionales y tridimensionales. Estos parámetros se utilizan generalmente para estudios de formación de nuevo hueso, como la ingeniería de tejidos y estudios de biomateriales. Se utilizan diferentes métodos de umbral para la segmentación de imágenes de los parámetros micromorfo-métricos óseos. Sin embargo, estos diferentes métodos de umbral proporcionan diferentes resultados para los huesos analizados. Este estudio tuvo como objetivo comparar métodos de umbral para evaluar los parámetros micromorfo-métricos óseos en el hueso de ratón. Se utilizó un conjunto de datos que contenía 15 tibias de ratón para analizar los diferentes métodos de umbral para el análisis de parámetros micromorfo-métricos óseos. Estos métodos de umbral se utilizaron para analizar la tibia de ratón (= 15) con huesos umbralizados. Los métodos de umbral y el análisis se utilizaron directamente desde CTAn (Bruker Micro-CT). Los resultados se compararon entre los métodos de umbral, que incluían volumen óseo, número trabecular, conectividad, separación trabecular y otros parámetros. Hubo acuerdo hasta cierto punto para todos los análisis micromorfo-métricos óseos utilizando los diferentes métodos de umbral. Los resultados mostraron que el método de umbral mostró un buen acuerdo para la conectividad y el grosor trabecular, pero los otros parámetros mostraron un acuerdo limitado. La evaluación de los métodos de umbral permite la comparación de la segmentación de imágenes y la cuantificación de los parámetros micromorfo-métricos de la tibia de ratón. Este estudio puede permitir el análisis de parámetros micromorfo-métricos óseos utilizando el método de umbral relativamente cercano en la segmentación de imágenes a través de diferentes grupos de investigación.