Este documento presenta un estudio experimental que analiza el comportamiento visual de los estudiantes y la actividad cerebral en el razonamiento clínico. Se definió un protocolo de adquisición para registrar datos de seguimiento ocular y EEG de 15 participantes mientras interactúan con un entorno de aprendizaje basado en computadora llamado Amnesia, un sistema de simulación médica que evalúa las habilidades analíticas de los estudiantes de medicina novatos mientras resuelven casos de pacientes. Utilizamos datos de la mirada para evaluar el enfoque visual de los estudiantes y presentamos nuestra metodología para rastrear el proceso de razonamiento de los estudiantes a través del análisis de patrones de escaneo. También describimos nuestra metodología para examinar los estados cognitivos de los estudiantes utilizando índices neurales de compromiso mental y carga de trabajo. Finalmente, discutimos la relación entre la información de la ruta visual y el EEG y cómo nuestros análisis pueden llevar a nuevas formas de evaluación del razonamiento diagnóstico clínico.