Antecedentes: La rúcula es un cultivo de aceites esenciales de especies crucíferas a nivel mundial y se utiliza como verdura para ensaladas. Las hojas moradas de la planta proporcionan nutrientes beneficiosos para los seres humanos y se atribuyen principalmente a los altos niveles de antocianinas. En este estudio, recolectamos un cultivar de rúcula con hojas moradas y otra con hojas verdes. Las bases genéticas y los mecanismos subyacentes a la formación de hojas moradas en la rúcula siguen siendo desconocidos. Por lo tanto, llevamos a cabo un análisis integrado de metabolómica y transcriptómica de dos cultivares de rúcula con diferentes colores de hojas.