Aunque se ha conocido durante décadas que el mejillón es un excelente bioindicador de la contaminación por elementos traza en el medio marino, aún no hay información sobre los efectos de un conjunto de sus principales parámetros morfométricos y la edad en los niveles de elementos traza en los tejidos blandos. En este trabajo, utilizando espectrometría de masas con plasma acoplado inductivamente, estudiamos los contenidos de 72 elementos en tejidos blandos de mejillones de 0.5 a 4 años, que fueron muestreados en tres estaciones dentro de un cuerpo de agua relativamente pequeño, la Bahía de Sebastopol. Se descubrieron efectos significativos de la edad y la ubicación de muestreo en los contenidos de elementos y la relación peso seco/peso húmedo de los tejidos blandos. Los efectos del sexo no fueron significativos. Se presumió por primera vez que la disminución en el contenido de elementos en los tejidos blandos de los mejillones jóvenes puede estar asociada con la disminución de las necesidades fisiológicas de contenidos elevados de elementos esenciales y agua intracelular con la edad. Combinaciones de seis parámetros morfométricos principales mostraron que una función de tan solo tres parámetros (peso seco del tejido blando, peso total del molusco y altura de la concha, con la mayor contribución del ratio peso seco/peso total) formó correlaciones significativas con los contenidos del mayor número posible de elementos (69-88% del total). Por primera vez, se demostró que el análisis discriminante lineal y el análisis canónico de coordenadas principales pueden ser utilizados con éxito para rastrear el origen exacto de las muestras de mejillón dentro de un área de agua tan pequeña. El análisis canónico de coordenadas principales demostró ser superior en la clasificación correcta de las muestras.