El análisis de snrks revela pistas sobre la evolución de esta familia y un nuevo conjunto de biomarcadores de resistencia al estrés abiótico
Autores: Colina, Francisco Javier; Carbó, María; Álvarez, Ana; Valledor, Luis; Cañal, María Jesús
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
El análisis de snrks revela pistas sobre la evolución de esta familia y un nuevo conjunto de biomarcadores de resistencia al estrés abiótico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Cambio climático
Factores de estrés ambiental
Vías de señalización del estrés de las plantas
SnRK
Gimnospermas
Resistencia al estrés
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 21
Citaciones: Sin citaciones
El cambio climático está aumentando la intensidad y la incidencia de factores de estrés ambiental, reduciendo los rendimientos de biomasa de las especies forestales. Por lo tanto, se requiere la selección de nuevas variedades tolerantes al estrés. Muchos genes relacionados con las vías de señalización del estrés en las plantas han demostrado ser útiles para este propósito, con las quinasas relacionadas con la no fermentación de sacarosa (SnRK), conservadas a lo largo de la evolución de las plantas y conectadas a diferentes cascadas de fosforilación dentro de las vías de señalización mediadas por ABA y Ca, como un buen ejemplo. La modulación de SnRKs y/o la selección de alelos específicos de SnRK han demostrado ser estrategias exitosas para aumentar la resistencia al estrés de las plantas. A pesar de esto, los SnRKs apenas han sido estudiados en las gimnospermas. En este trabajo, las secuencias de SnRK (PpiSnRK) fueron identificadas a través de un análisis de secuencia basado en homología y dominio utilizando secuencias de SnRK como consulta. Además, los enlaces de PpiSnRKs con la respuesta al estrés de las gimnospermas fueron modelados a partir de las interacciones conocidas de los ortólogos de PpiSnRKs de otras especies con diferentes complejidades de señalización. Este enfoque identificó con éxito la familia de SnRK de pino y predijo su papel central en la respuesta al estrés de las gimnospermas, vinculándolos a ABA, Ca, azúcar/energía y posiblemente a la señalización de etileno. Estos enlaces convierten a las quinasas de las gimnospermas en prometedores candidatos en la búsqueda de nuevos biomarcadores relacionados con la resistencia al estrés, que serían útiles en futuras estrategias de cría.
Descripción
El cambio climático está aumentando la intensidad y la incidencia de factores de estrés ambiental, reduciendo los rendimientos de biomasa de las especies forestales. Por lo tanto, se requiere la selección de nuevas variedades tolerantes al estrés. Muchos genes relacionados con las vías de señalización del estrés en las plantas han demostrado ser útiles para este propósito, con las quinasas relacionadas con la no fermentación de sacarosa (SnRK), conservadas a lo largo de la evolución de las plantas y conectadas a diferentes cascadas de fosforilación dentro de las vías de señalización mediadas por ABA y Ca, como un buen ejemplo. La modulación de SnRKs y/o la selección de alelos específicos de SnRK han demostrado ser estrategias exitosas para aumentar la resistencia al estrés de las plantas. A pesar de esto, los SnRKs apenas han sido estudiados en las gimnospermas. En este trabajo, las secuencias de SnRK (PpiSnRK) fueron identificadas a través de un análisis de secuencia basado en homología y dominio utilizando secuencias de SnRK como consulta. Además, los enlaces de PpiSnRKs con la respuesta al estrés de las gimnospermas fueron modelados a partir de las interacciones conocidas de los ortólogos de PpiSnRKs de otras especies con diferentes complejidades de señalización. Este enfoque identificó con éxito la familia de SnRK de pino y predijo su papel central en la respuesta al estrés de las gimnospermas, vinculándolos a ABA, Ca, azúcar/energía y posiblemente a la señalización de etileno. Estos enlaces convierten a las quinasas de las gimnospermas en prometedores candidatos en la búsqueda de nuevos biomarcadores relacionados con la resistencia al estrés, que serían útiles en futuras estrategias de cría.