En los últimos años, las emergencias de salud pública se han vuelto frecuentes en todo el mundo. En respuesta a estas emergencias complejas y en evolución, las organizaciones involucradas están colaborando cada vez más entre sí. Desde una perspectiva de pensamiento sistémico, se debe prestar mayor atención al desarrollo a largo plazo y al funcionamiento continuo de los sistemas de colaboración en emergencias. Al segmentar el desarrollo de la epidemia de COVID-19 en Wuhan, se pueden establecer respectivamente las diferentes fases de las redes de colaboración en emergencias. Se propone un nuevo método para identificar nodos clave de organizaciones y diferentes estrategias de ataque a la red, evaluando la efectividad de la red desde dos dimensiones: eficiencia y resiliencia. Los resultados indican que, en comparación con las estrategias de ataque aleatorias, la eficiencia y la resiliencia de estas redes se ven significativamente afectadas por estrategias de ataque deliberadas, subrayando la sensibilidad de la red a nodos de alta importancia. Basándose en las variaciones en la eficiencia y resiliencia de la red, la efectividad de diferentes formas de redes se clasifica en cuatro tipos. La red pre-emergencia se categoriza como centrada en la resiliencia, la red en medio de la emergencia como orientada a la eficiencia, la red post-emergencia como eficiente-resiliente, y la red de emergencia en general como ineficiente-frágil. Analizar las formas de efectividad de la red en diferentes fases ofrece una comprensión más profunda de las características operativas, los cambios dinámicos y los problemas existentes dentro de las redes de colaboración en emergencias. Este estudio proporciona una base teórica vital y orientación práctica para los departamentos de gestión de emergencias y los tomadores de decisiones sobre cómo mejorar efectivamente los mecanismos de colaboración entre diferentes organizaciones.