La desaturasa de estearoil-CoA-1 es una enzima clave en la biosíntesis de ácidos grasos monoinsaturados y se considera un gen candidato para mejorar las características de calidad de la leche y la carne. Se empleó la secuenciación de Sanger para investigar el polimorfismo genético del quinto exón e intrón de bovino, revelando cuatro SNPs, g.21272246 A>G, g.21272306 T>C, g.21272422 C>T y g.21272529 A>G. Se realizaron análisis de varianza y comparaciones múltiples para examinar la relación entre los sitios de variación y las características económicas en el ganado Simmental chino, así como las características de producción de leche en vacas Holstein. Los hallazgos revelaron que estos cuatro loci exhibieron asociaciones significativas con características de canal (peso de canal, longitud de canal, grosor de grasa dorsal y grosor de carne en la cintura), calidad de la carne (valor de pH, área del ojo de la costilla y puntuación de marmoleo), características adipogénicas (puntuación de grasa y tasa de cobertura de grasa en canal) y composición de ácidos grasos (ácido linoleico y ácido alfa-linolénico). Además, se encontró que estos loci estaban significativamente asociados con el rendimiento promedio de leche y el contenido de grasa en la leche en vacas. Además, un análisis de haplotipos de combinaciones de SNPs mostró que H2H3 tiene una asociación significativa con características adipogénicas y H2H2 estaba asociado con niveles más altos de ácido linoleico y ácido alfa-linolénico que las otras combinaciones. Estos resultados sugieren que los cuatro SNPs se esperan como marcadores genéticos prospectivos para las características económicas mencionadas. Además, la función de los SNPs en el exón 5 sobre la expresión génica y la estructura de proteínas necesita ser explorada en el futuro.