Al conservar la diversidad genética de las razas de animales domésticos, las estrategias que enfatizan la diversidad entre razas pueden no ser óptimas, ya que descuidan la variación dentro de las razas. El objetivo del presente estudio fue evaluar la extensión de la subdivisión poblacional en tres razas de cerdo Mangalica y la contribución de la migración a su subestructura. Se calculó el coeficiente de Wright basado en datos genealógicos de animales de cría nacidos entre 1981 y 2023, con tres variantes de color (Rubio, Barriga de Golondrina y Rojo). Estos coeficientes de Wright se analizaron utilizando escalado multidimensional para revelar la subestructura poblacional. El coeficiente promedio fue de 0.04 para la raza Rubio y 0.047 para las razas Mangalica Barriga de Golondrina y Roja, mientras que estos parámetros fueron más bajos en los rebaños activos, con 0.03 y 0.04, respectivamente. La migración de individuos entre rebaños fue del 61.63% para la raza Rubio y del 75.53% y 63.64% para las razas Mangalica Barriga de Golondrina y Roja, respectivamente. No se observó subestructura poblacional en ninguna de las razas Mangalica, lo que puede explicarse por la extensa migración entre rebaños.