Análisis de modelo de proteínas y función en la vía de detección de quórum de sp.-Q67
Autores: Wang, Ze-Jun; Chen, Fu; Xu, Ya-Qian; Huang, Peng; Liu, Shu-Shen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Análisis de modelo de proteínas y función en la vía de detección de quórum de sp.-Q67
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Bacterias bioluminiscentes
Hábitats marinos
Bacteria de agua dulce
Contaminación ambiental
Evaluación de toxicidad
Sistema de detección de quórum
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 18
Citaciones: Sin citaciones
Las bacterias bioluminiscentes se encuentran principalmente en hábitats marinos. La bacteria de agua dulce no patógena sp.-Q67 (Q67) ha sido objeto de atención debido a su amplio uso en el monitoreo de la contaminación ambiental y la evaluación de la toxicidad. Sin embargo, la falta de estructuras cristalinas disponibles limita la elucidación de las estructuras de las proteínas funcionales del sistema de detección de quorum (QS) que regula la luminescencia bacteriana en Q67. En este estudio, se construyeron 19 proteínas funcionales a través de modelado de monómeros y oligómeros basados en sus proteínas codificadoras en el sistema QS de Q67 utilizando MODELLER. Excepto por la imposibilidad de construir LuxM debido a la falta de un plantilla adecuada, 18 proteínas funcionales se construyeron con éxito. Además, se exploraron las relaciones entre la función y las estructuras predichas de las 19 proteínas funcionales una por una de acuerdo con las tres clasificaciones funcionales: sintasas y receptores de autoinductores, proteínas de transmisión de señales (fosfotransferasas, un chaperona de ARN y un regulador transcripcional), y enzimas involucradas en reacciones de bioluminiscencia bacteriana. Este es el primer análisis de todo el proceso de regulación de la bioluminiscencia desde la perspectiva de las bacterias de agua dulce no patógenas a nivel molecular. Proporciona una base teórica para la explicación de las aplicaciones de Q67 en las que se utiliza la inhibición luminescente como punto final.
Descripción
Las bacterias bioluminiscentes se encuentran principalmente en hábitats marinos. La bacteria de agua dulce no patógena sp.-Q67 (Q67) ha sido objeto de atención debido a su amplio uso en el monitoreo de la contaminación ambiental y la evaluación de la toxicidad. Sin embargo, la falta de estructuras cristalinas disponibles limita la elucidación de las estructuras de las proteínas funcionales del sistema de detección de quorum (QS) que regula la luminescencia bacteriana en Q67. En este estudio, se construyeron 19 proteínas funcionales a través de modelado de monómeros y oligómeros basados en sus proteínas codificadoras en el sistema QS de Q67 utilizando MODELLER. Excepto por la imposibilidad de construir LuxM debido a la falta de un plantilla adecuada, 18 proteínas funcionales se construyeron con éxito. Además, se exploraron las relaciones entre la función y las estructuras predichas de las 19 proteínas funcionales una por una de acuerdo con las tres clasificaciones funcionales: sintasas y receptores de autoinductores, proteínas de transmisión de señales (fosfotransferasas, un chaperona de ARN y un regulador transcripcional), y enzimas involucradas en reacciones de bioluminiscencia bacteriana. Este es el primer análisis de todo el proceso de regulación de la bioluminiscencia desde la perspectiva de las bacterias de agua dulce no patógenas a nivel molecular. Proporciona una base teórica para la explicación de las aplicaciones de Q67 en las que se utiliza la inhibición luminescente como punto final.