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Caracterización de dos mitogenomas de (Anura: Hylidae), con relaciones filogenéticas y análisis de presión de selección de Hylidae

Autores: Hong, Yue-Huan; Huang, Hai-Ming; Wu, Lian; Storey, Kenneth B.; Zhang, Jia-Yong; Zhang, Yong-Pu; Yu, Dan-Na

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Caracterización de dos mitogenomas de (Anura: Hylidae), con relaciones filogenéticas y análisis de presión de selección de Hylidae


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Endémico
China
Mitogenomas
Filogenético
Genes
Selección

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
(Anura: Hylidae) es endémica de China y se distribuye por las provincias de Anhui, Zhejiang, Fujian, Guangdong, Guangxi, Hunan y Guizhou. Se secuenciaron los mitogenomas de dos sitios diferentes (Jinxiu, Guangxi, y Wencheng, Zhejiang). Se realizaron análisis filogenéticos, incluyendo 38 mitogenomas de Hylidae de la base de datos de NCBI, y se evaluó la relación filogenética dentro del conjunto de datos analizado. Dos mitogenomas mostraron la típica disposición de genes mitocondriales con 13 genes que codifican proteínas (PCGs), dos genes de ARN ribosómico (ARNr 12S y ARNr 16S), 22 genes de ARN de transferencia (tRNA) y una región de control no codificante (D-loop). Las longitudes de los genes ARNr 12S y ARNr 16S de ambas muestras (Jinxiu y Wencheng) fueron de 933 pb y 1604 pb, respectivamente. La distancia genética (distancia transformada en porcentaje) sobre la base de los mitogenomas (excluyendo la región de control) de las dos muestras se calculó como 4.4%. mostró una relación filogenética cercana con el clado de ( + ), lo cual fue respaldado por análisis de ML y BI. En el modelo de rama-sitio, se encontraron cinco sitios de selección positiva en el clado de y : la proteína Cytb (en la posición 316), la proteína ND3 (en la posición 85) y la proteína ND5 (en la posición 400) tienen un sitio, respectivamente, y dos sitios en la proteína ND4 (en las posiciones 47 y 200). Basado en los resultados, hipotetizamos que la selección positiva de y se debió a su experiencia de estrés por frío en eventos históricos, pero se necesita más evidencia para apoyar esta conclusión.

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