Debido al crecimiento de la población y la expansión urbana en la ciudad de Ulaanbaatar (UB), Mongolia, el análisis de peligros y riesgos para futuros terremotos se ha convertido en un tema importante para la planificación de la mitigación de desastres. La evaluación del efecto del sitio es una de las partes esenciales de la estimación del peligro sísmico en esta área. El efecto del sitio se puede evaluar mediante las amplificaciones del sitio calculadas a partir de modelos de velocidad de ondas de corte, que incluyen desde la roca madre hasta las capas superficiales. Sin embargo, es difícil evaluar el patrón de los efectos del sitio en UB debido a que son poco profundos, principalmente hasta 15 m, y hay un número reducido de modelos investigados disponibles en estudios previos. En este estudio, los modelos se estiman utilizando datos de microtemblores en 50 sitios y se aplica un análisis de inversión a los datos observados para evaluar las amplificaciones del sitio en UB. En particular, se aplica la técnica de inversión conjunta basada en un enfoque de campo difuso para estimar las estructuras en tres sitios utilizando las relaciones espectrales horizontales a verticales (H/V) observadas y las velocidades de fase de ondas superficiales obtenidas por Odonbaatar (2011). El resto de los sitios se estima mediante la técnica de inversión simple utilizando las relaciones espectrales H/V de microtemblores observadas, considerando los resultados de las inversiones conjuntas. La microzonificación sísmica en UB se realiza en función de las amplificaciones del sitio calculadas a partir de los modelos invertidos para caracterizar el patrón del peligro sísmico. El resultado muestra que la zona de amplificación del sitio más grande se calcula a lo largo del río Tuul en la parte sureste de UB.