La cianoficocianina (C-PC) es una biliproteína que absorbe luz y se encuentra en cianobacterias, comúnmente conocidas como algas verdeazuladas. Debido a sus propiedades antioxidantes, antiinflamatorias y anticancerígenas, esta proteína es una sustancia prometedora en medicina y farmacéutica. Sin embargo, las cianobacterias tienden a unir metales pesados del medio ambiente, lo que hace necesario garantizar la seguridad de la C-PC para el desarrollo de productos farmacéuticos, con C-PC aislada de biomasa de cianobacterias recolectadas de forma natural. Este estudio tuvo como objetivo determinar el contenido de los metales pesados más tóxicos, arsénico (As), cadmio (Cd), mercurio (Hg) y plomo (Pb) en C-PC aislada de diferentes biomasas de cianobacterias recolectadas en la Laguna de Kaunas durante 2019-2022, y compararlos con el contenido de metales pesados en C-PC aislada de cianobacterias cultivadas. Las cianobacterias de spp. dominaron la biomasa recolectada en 2019, mientras que el género dominó las biomasas recolectadas en los años 2020 y 2022. Los metales pesados se determinaron utilizando espectrometría de masas con plasma acoplado inductivamente (ICP-MS). El análisis de ICP-MS reveló niveles más altos de los metales pesados más investigados (Pb, Cd y As) en C-PC aislada de la biomasa con spp. dominante en comparación con C-PC aislada de la biomasa con el predominante . Mientras tanto, la C-PC aislada de cianobacterias cultivadas mostró concentraciones más bajas de As y Pb que la C-PC aislada de biomasa de cianobacterias recolectadas de forma natural.