Análisis de interacción computacional de proteína de unión a olores (SnocOBP7) combinada con feromonas sexuales femeninas y volátiles fúngicos simbióticos
Autores: Li, Yi-Ni; Hao, En-Hua; Li, Han; Yuan, Xiao-Hui; Lu, Peng-Fei; Qiao, Hai-Li
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Análisis de interacción computacional de proteína de unión a olores (SnocOBP7) combinada con feromonas sexuales femeninas y volátiles fúngicos simbióticos
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Proteína específica masculina
Feromonas
Descomposición de la energía de unión
Residuos
Simulación computacional
Interacción olfativa
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 24
Citaciones: Sin citaciones
, un importante plaga de cuarentena forestal, se ha propagado rápidamente y causado graves daños. Sin embargo, los métodos existentes aún necesitan ser mejorados porque no se comprenden bien los mecanismos de interacción olfativa. Para estudiar el papel de la proteína específica del macho SnocOBP7 en las interacciones proteína-ligando, la seleccionamos como objeto de simulación y análisis computacional. Al acoplarla con 11 ligandos y evaluar la descomposición de la energía de unión libre, se encontró que los tres mejores ligandos de unión son feromonas sexuales femeninas ((-)-7-heptacoseno y (-)-7-nonacoseno) y volátiles fúngicos simbióticos ((-)-globulol). El análisis del modo de unión y el escaneo alanino computacional sugirieron que cinco residuos desempeñan roles clave en la unión de cada feromona sexual femenina a SnocOBP7, mientras que dos residuos desempeñan roles clave en la unión de (-)-globulol. Phe108 y Leu36 pueden ser los sitios cruciales a través de los cuales SnocOBP7 se une a las feromonas sexuales femeninas, mientras que Met40 puede regular el comportamiento de cortejo de los machos, y Leu61 puede estar relacionado con el apareamiento y la búsqueda de hospedadores. Nuestros estudios predijeron la función de SnocOBP7 y encontraron que la interacción entre SnocOBP7 y la feromona es un proceso complejo, y predijimos con éxito sus sitios clave de unión de aminoácidos, proporcionando una base para el desarrollo de nuevos métodos de prevención y control que dependen de feromonas sexuales femeninas y hongos simbióticos.
Descripción
, un importante plaga de cuarentena forestal, se ha propagado rápidamente y causado graves daños. Sin embargo, los métodos existentes aún necesitan ser mejorados porque no se comprenden bien los mecanismos de interacción olfativa. Para estudiar el papel de la proteína específica del macho SnocOBP7 en las interacciones proteína-ligando, la seleccionamos como objeto de simulación y análisis computacional. Al acoplarla con 11 ligandos y evaluar la descomposición de la energía de unión libre, se encontró que los tres mejores ligandos de unión son feromonas sexuales femeninas ((-)-7-heptacoseno y (-)-7-nonacoseno) y volátiles fúngicos simbióticos ((-)-globulol). El análisis del modo de unión y el escaneo alanino computacional sugirieron que cinco residuos desempeñan roles clave en la unión de cada feromona sexual femenina a SnocOBP7, mientras que dos residuos desempeñan roles clave en la unión de (-)-globulol. Phe108 y Leu36 pueden ser los sitios cruciales a través de los cuales SnocOBP7 se une a las feromonas sexuales femeninas, mientras que Met40 puede regular el comportamiento de cortejo de los machos, y Leu61 puede estar relacionado con el apareamiento y la búsqueda de hospedadores. Nuestros estudios predijeron la función de SnocOBP7 y encontraron que la interacción entre SnocOBP7 y la feromona es un proceso complejo, y predijimos con éxito sus sitios clave de unión de aminoácidos, proporcionando una base para el desarrollo de nuevos métodos de prevención y control que dependen de feromonas sexuales femeninas y hongos simbióticos.