Identificación y Análisis de Expresión de la Familia de Hexoquinasas en L. bajo Estrés por Sequía y Frío
Autores: Liu, Ying; Jiang, Yaolan; Liu, Xiaolan; Cheng, Hefen; Han, Yuekun; Zhang, Dawei; Wu, Jinfeng; Liu, Lili; Yan, Mingli; Que, Youxiong; Zhou, Dinggang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y Análisis de Expresión de la Familia de Hexoquinasas en L. bajo Estrés por Sequía y Frío
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia de múltiples genes
Hexoquinasas
Caña de azúcar
Estructura genética
Análisis filogenético
Patrones de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
En las plantas, la familia de genes de hexokinasa de doble función (HXKs) desempeña un papel importante en el metabolismo y la detección de azúcares, lo que afecta el crecimiento y la adaptación al estrés. La caña de azúcar es un cultivo importante de sacarosa y de biocombustible. Sin embargo, se conoce poco sobre la familia de genes en la caña de azúcar. Se realizó una encuesta exhaustiva de la caña de azúcar, incluyendo propiedades fisicoquímicas, distribución cromosómica, motivos conservados y estructura genética, identificando 20 miembros de la familia de genes que se localizaron en siete de los 32 cromosomas de L. El análisis filogenético mostró que la familia podría dividirse en tres subfamilias (grupo I, II y III). Los motivos y la estructura genética estaban relacionados con la clasificación. La mayoría contenía de 8 a 11 intrones, lo que era consistente con otros monocotiledóneas. El análisis de eventos de duplicación indicó que en L. se originó principalmente a partir de duplicación segmentaria. También identificamos elementos cis potenciales en las regiones promotoras que estaban involucrados en respuestas a fitohormonas, luz y estrés abiótico (sequía, frío, etc.). Durante el crecimiento y desarrollo normales, 17 se expresaron de manera constitutiva en los diez tejidos. Entre ellos, y tenían patrones de expresión similares y se expresaron más que otros genes en todo momento. El análisis de RNA-seq mostró que 14/20 tuvieron el nivel de expresión más alto después del estrés por frío durante 6 horas, especialmente, y. En cuanto al tratamiento de sequía, 7/20 tuvieron el nivel de expresión más alto después del estrés por sequía durante 10 días, 3/20 (y) tuvieron el nivel de expresión más alto después de 10 días de recuperación. En general, nuestros resultados revelaron la posible función biológica de, lo que puede proporcionar información para una verificación funcional más profunda.
Descripción
En las plantas, la familia de genes de hexokinasa de doble función (HXKs) desempeña un papel importante en el metabolismo y la detección de azúcares, lo que afecta el crecimiento y la adaptación al estrés. La caña de azúcar es un cultivo importante de sacarosa y de biocombustible. Sin embargo, se conoce poco sobre la familia de genes en la caña de azúcar. Se realizó una encuesta exhaustiva de la caña de azúcar, incluyendo propiedades fisicoquímicas, distribución cromosómica, motivos conservados y estructura genética, identificando 20 miembros de la familia de genes que se localizaron en siete de los 32 cromosomas de L. El análisis filogenético mostró que la familia podría dividirse en tres subfamilias (grupo I, II y III). Los motivos y la estructura genética estaban relacionados con la clasificación. La mayoría contenía de 8 a 11 intrones, lo que era consistente con otros monocotiledóneas. El análisis de eventos de duplicación indicó que en L. se originó principalmente a partir de duplicación segmentaria. También identificamos elementos cis potenciales en las regiones promotoras que estaban involucrados en respuestas a fitohormonas, luz y estrés abiótico (sequía, frío, etc.). Durante el crecimiento y desarrollo normales, 17 se expresaron de manera constitutiva en los diez tejidos. Entre ellos, y tenían patrones de expresión similares y se expresaron más que otros genes en todo momento. El análisis de RNA-seq mostró que 14/20 tuvieron el nivel de expresión más alto después del estrés por frío durante 6 horas, especialmente, y. En cuanto al tratamiento de sequía, 7/20 tuvieron el nivel de expresión más alto después del estrés por sequía durante 10 días, 3/20 (y) tuvieron el nivel de expresión más alto después de 10 días de recuperación. En general, nuestros resultados revelaron la posible función biológica de, lo que puede proporcionar información para una verificación funcional más profunda.