Identificación de Genes de la Familia y Análisis de Expresión bajo Tratamiento con Giberelinas en Piña ( (L.) Merr.)
Autores: Zhu, Wenhui; Qi, Jingang; Chen, Jingdong; Ma, Suzhuo; Liu, Kaichuang; Su, Han; Chai, Mengnan; Huang, Youmei; Xi, Xinpeng; Cao, Zhuangyuan; Qin, Yuan; Cai, Hanyang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación de Genes de la Familia y Análisis de Expresión bajo Tratamiento con Giberelinas en Piña ( (L.) Merr.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Giberelina
Genoma de piña
Expresión génica
Análisis filogenético
Estructura génica
QRT-PCR
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
La giberelina (GAs) desempeña un papel regulador importante en el desarrollo y crecimiento de la piña ( (L.) Merr.). Se utilizó bioinformática para confirmar la expresión diferencial del gen giberelina oxidasa GA2 en el genoma de la piña, lo que sentó las bases para explorar su papel en la piña. En este estudio, se identificaron 42 genes en el genoma de la piña, nombrados de a , y se dividieron en cuatro grupos según el análisis filogenético. También analizamos la estructura del gen, los motivos conservados y la localización cromosómica de AcGA2oxs. Los AcGA2oxs dentro del mismo grupo tenían una estructura de gen y composición de motivos similares. El análisis colineal y el análisis de elementos cis proporcionaron la base para comprender la evolución y función de los genes en la piña. Además, seleccionamos diferentes partes de tejido para analizar el perfil de expresión de , y los resultados muestran que 41 genes se expresaron, excepto por . puede no expresarse en estos sitios o puede ser pseudogenes. Se utilizó qRT-PCR (PCR cuantitativa en tiempo real por fluorescencia) para detectar los niveles de expresión relativa de la familia de genes bajo diferentes concentraciones de tratamiento con GA3, y se encontró que la expresión génica se reguló al alza en diferentes grados bajo el tratamiento con GA3. Estos resultados proporcionan información útil para un estudio más profundo sobre la evolución y función de la familia en la piña.
Descripción
La giberelina (GAs) desempeña un papel regulador importante en el desarrollo y crecimiento de la piña ( (L.) Merr.). Se utilizó bioinformática para confirmar la expresión diferencial del gen giberelina oxidasa GA2 en el genoma de la piña, lo que sentó las bases para explorar su papel en la piña. En este estudio, se identificaron 42 genes en el genoma de la piña, nombrados de a , y se dividieron en cuatro grupos según el análisis filogenético. También analizamos la estructura del gen, los motivos conservados y la localización cromosómica de AcGA2oxs. Los AcGA2oxs dentro del mismo grupo tenían una estructura de gen y composición de motivos similares. El análisis colineal y el análisis de elementos cis proporcionaron la base para comprender la evolución y función de los genes en la piña. Además, seleccionamos diferentes partes de tejido para analizar el perfil de expresión de , y los resultados muestran que 41 genes se expresaron, excepto por . puede no expresarse en estos sitios o puede ser pseudogenes. Se utilizó qRT-PCR (PCR cuantitativa en tiempo real por fluorescencia) para detectar los niveles de expresión relativa de la familia de genes bajo diferentes concentraciones de tratamiento con GA3, y se encontró que la expresión génica se reguló al alza en diferentes grados bajo el tratamiento con GA3. Estos resultados proporcionan información útil para un estudio más profundo sobre la evolución y función de la familia en la piña.