Identificación y análisis de expresión de la familia de genes en x Sweet con diferentes colores de flores
Autores: Sheng, Jiaran; Shen, Jianshang; Shan, Yingying; Chen, Xia; Li, Xueqin; Wang, Huasen; Jin, Songheng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación y análisis de expresión de la familia de genes en x Sweet con diferentes colores de flores
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción
Plantas leñosas
Familia de genes
Dominios bHLH
Elementos cis-regulatorios
Enciclopedia de Genes y Genomas de Kioto
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción de hélice-bucle-hélice (bHLH) juegan roles significativos en el crecimiento de las plantas y el desarrollo de órganos, así como en diversos procesos bioquímicos. Sin embargo, la función de los factores de transcripción en las plantas leñosas no se comprende completamente. En este estudio, se identificó y caracterizó la familia de genes en x Sweet utilizando datos de genoma completo. Se identificaron un total de 109 genes de la familia, y se analizaron sus niveles de expresión en flores de diferentes colores y etapas de desarrollo. Los resultados mostraron que la familia se divide en 24 subfamilias. Los análisis de localización cromosómica y colinealidad revelaron numerosos eventos de duplicación durante la evolución, que es una de las principales razones de la diversificación de las funciones génicas. Los dominios bHLH mostraron una conservación relativa de las proteínas RpbHLH. En las regiones promotoras de los genes, se identificaron varios elementos cis-regulatorios involucrados en la respuesta a la luz, la respuesta al ácido giberélico (GA) y la respuesta al ácido abscísico (ABA). Estos elementos pueden regular el desarrollo de las flores y la síntesis de pigmentos. Un análisis de enriquecimiento funcional de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG) del objetivo reveló que 25 genes están enriquecidos en la vía biosintética de los flavonoides. Se identificaron potenciales relacionados con el desarrollo de flores y la síntesis de pigmentos a través de un análisis de transcriptoma y se validaron mediante PCR cuantitativa de transcripción inversa (qRT-PCR). Este estudio mejorará nuestra comprensión de las funciones y proporcionará una referencia para el estudio del desarrollo y la coloración de las flores.
Descripción
Los factores de transcripción de hélice-bucle-hélice (bHLH) juegan roles significativos en el crecimiento de las plantas y el desarrollo de órganos, así como en diversos procesos bioquímicos. Sin embargo, la función de los factores de transcripción en las plantas leñosas no se comprende completamente. En este estudio, se identificó y caracterizó la familia de genes en x Sweet utilizando datos de genoma completo. Se identificaron un total de 109 genes de la familia, y se analizaron sus niveles de expresión en flores de diferentes colores y etapas de desarrollo. Los resultados mostraron que la familia se divide en 24 subfamilias. Los análisis de localización cromosómica y colinealidad revelaron numerosos eventos de duplicación durante la evolución, que es una de las principales razones de la diversificación de las funciones génicas. Los dominios bHLH mostraron una conservación relativa de las proteínas RpbHLH. En las regiones promotoras de los genes, se identificaron varios elementos cis-regulatorios involucrados en la respuesta a la luz, la respuesta al ácido giberélico (GA) y la respuesta al ácido abscísico (ABA). Estos elementos pueden regular el desarrollo de las flores y la síntesis de pigmentos. Un análisis de enriquecimiento funcional de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG) del objetivo reveló que 25 genes están enriquecidos en la vía biosintética de los flavonoides. Se identificaron potenciales relacionados con el desarrollo de flores y la síntesis de pigmentos a través de un análisis de transcriptoma y se validaron mediante PCR cuantitativa de transcripción inversa (qRT-PCR). Este estudio mejorará nuestra comprensión de las funciones y proporcionará una referencia para el estudio del desarrollo y la coloración de las flores.