Identificación y análisis de expresión del gen de la familia de factores de respuesta al etileno en la planta de té ()
Autores: Zhang, Tao; Cai, Ju; Wang, Sisi; Lv, Litang; Yuan, Dandan; Zeng, Xiaofang; Li, Jianrong; Li, Yan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y análisis de expresión del gen de la familia de factores de respuesta al etileno en la planta de té ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Familia de genes
Desarrollo de semillas de plantas
Tensiones abióticas
Análisis de herramientas de bioinformática
Características moleculares
Evolución sistemática
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
La familia génica está ampliamente presente en las plantas y tiene una importancia regulatoria crucial en el desarrollo de la semilla de la planta, la morfogénesis de los órganos, la síntesis de metabolitos secundarios y la adaptación a tensiones abióticas como el frío y la sequía. En este estudio, se analizaron 90 miembros por herramientas de bioinformática y se nombraron -. Se estudiaron sus características moleculares y evolución sistemática, se predijeron las características de expresión de los genes en tejidos y la composición de elementos cis-actuantes del promotor. Los resultados mostraron que 81 proteínas codificadas por genes tenían motivos conservados 1, 2 y 3, mientras que 64 miembros poseían otros motivos. El punto isoeléctrico teórico estaba entre 4,49 y 10,24, y 85 miembros constituían proteínas inestables, mientras que el resto eran proteínas estables. La localización subcelular predijo que 77 miembros estaban en el núcleo, 8 en los cloroplastos y 5 en las mitocondrias. Se encontró que la secuencia del promotor incluía elementos cis-actuantes relacionados no solo con la regulación hormonal, como la giberelina (41), el jasmonato de metilo (110) y el ácido abscísico (185), sino también con elementos cis-actuantes involucrados en la respuesta a bajas temperaturas (56) y a la luz (22), lo que indica que tienen un papel clave en el crecimiento de la planta y el estrés abiótico. El análisis filogenético de la planta de té y las familias génicas mostró que las familias génicas de la planta de té se podían dividir en seis grupos, siendo B3 el que tenía más miembros con 29 y B1 con solo 3 miembros como mínimo. El árbol filogenético construido solo con los genes CsERF también se dividió en seis grupos, con diferencias mínimas pero ligeramente diferentes en los miembros. De los 90 miembros de la planta de té, 85 estaban localizados en 15 cromosomas, mientras que 5 no estaban ubicados en cromosomas. El análisis de colinealidad mostró que había 41 pares de genes homólogos entre los , y estos pares de genes homólogos pueden tener la misma función. Según la expresión de en la planta de té estresada por el frío y en diferentes tejidos, los 90 genes desempeñaron sus respectivos roles en diferentes tejidos y etapas para regular el crecimiento de la planta, y algunos de ellos participaron en el proceso de tolerancia al frío. Este estudio proporciona una base teórica para el estudio del crecimiento y desarrollo de la planta de té y la resistencia a bajas temperaturas.
Descripción
La familia génica está ampliamente presente en las plantas y tiene una importancia regulatoria crucial en el desarrollo de la semilla de la planta, la morfogénesis de los órganos, la síntesis de metabolitos secundarios y la adaptación a tensiones abióticas como el frío y la sequía. En este estudio, se analizaron 90 miembros por herramientas de bioinformática y se nombraron -. Se estudiaron sus características moleculares y evolución sistemática, se predijeron las características de expresión de los genes en tejidos y la composición de elementos cis-actuantes del promotor. Los resultados mostraron que 81 proteínas codificadas por genes tenían motivos conservados 1, 2 y 3, mientras que 64 miembros poseían otros motivos. El punto isoeléctrico teórico estaba entre 4,49 y 10,24, y 85 miembros constituían proteínas inestables, mientras que el resto eran proteínas estables. La localización subcelular predijo que 77 miembros estaban en el núcleo, 8 en los cloroplastos y 5 en las mitocondrias. Se encontró que la secuencia del promotor incluía elementos cis-actuantes relacionados no solo con la regulación hormonal, como la giberelina (41), el jasmonato de metilo (110) y el ácido abscísico (185), sino también con elementos cis-actuantes involucrados en la respuesta a bajas temperaturas (56) y a la luz (22), lo que indica que tienen un papel clave en el crecimiento de la planta y el estrés abiótico. El análisis filogenético de la planta de té y las familias génicas mostró que las familias génicas de la planta de té se podían dividir en seis grupos, siendo B3 el que tenía más miembros con 29 y B1 con solo 3 miembros como mínimo. El árbol filogenético construido solo con los genes CsERF también se dividió en seis grupos, con diferencias mínimas pero ligeramente diferentes en los miembros. De los 90 miembros de la planta de té, 85 estaban localizados en 15 cromosomas, mientras que 5 no estaban ubicados en cromosomas. El análisis de colinealidad mostró que había 41 pares de genes homólogos entre los , y estos pares de genes homólogos pueden tener la misma función. Según la expresión de en la planta de té estresada por el frío y en diferentes tejidos, los 90 genes desempeñaron sus respectivos roles en diferentes tejidos y etapas para regular el crecimiento de la planta, y algunos de ellos participaron en el proceso de tolerancia al frío. Este estudio proporciona una base teórica para el estudio del crecimiento y desarrollo de la planta de té y la resistencia a bajas temperaturas.