Identificación y análisis de expresión del gen de fosfatasa ácida () en : Efectos de elementos de actuación en dos genes en respuesta al estrés por fósforo
Autores: Du, Hongyuan; Zhang, Ruiqian; Zhang, Qingxue; Shi, Xun; Wang, Jiaxue; Peng, Qian; Batool, Asfa; Li, Shisheng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación y análisis de expresión del gen de fosfatasa ácida () en : Efectos de elementos de actuación en dos genes en respuesta al estrés por fósforo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Fosfatasa ácida
Asimilación de fósforo
Genes
Residuos que ligan metales
Datos de RNA-seq
Estrés salino
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
Las fosfatasas ácidas púrpuras (PAPs) juegan un papel clave en la asimilación y redistribución de fósforo (P) en las plantas, catalizando la hidrólisis de ésteres fosfato para producir fosfato inorgánico (Pi). En este estudio, se identificaron un total de 77 genes. Los genes candidatos se dividieron en tres grupos y diez subgrupos basados en los análisis filogenéticos y la organización de exones e intrones. Entre estas 77 proteínas BnaPAP, 35 exhiben residuos típicos de unión a metales característicos de las PAPs conocidas, mientras que ciertos residuos de aminoácidos no alterados estaban ausentes o desplazados en otras BnaPAPs. Se realizó una predicción computacional, revelando que la mayoría de las PAPs contienen motivos de péptido señal y muestran una variedad de niveles de N-glicosilación, así como motivos de hélice transmembrana. Un análisis de datos de RNA-seq obtenidos previamente reveló que el 55.84% (43 de 77) respondieron a la deficiencia de Pi. Además, realizamos un examen preliminar de los perfiles de expresión de genes en respuesta al estrés salino, y descubrimos que el 42.86% (33 de 77) de estos genes fueron inducidos bajo estrés salino, ya sea en los brotes o en las raíces. Análisis adicionales de qRT-PCR y GUS revelaron que, dos parálagos de, fueron inducidos por la deficiencia de Pi. Notablemente, exhibe una inducción robusta, en comparación con la inducción relativamente leve observada en. Nuestra investigación muestra que responde de manera única al estrés de Pi a través de la caja W, mientras que predominantemente responde a través del elemento P1BS, y las diferencias en los elementos reguladores (CREs) dentro de sus regiones promotoras contribuyen específicamente a sus distintos niveles de expresión bajo estrés de Pi. Nuestros hallazgos proporcionan valiosos conocimientos y establecen una base para futuros estudios funcionales de.
Descripción
Las fosfatasas ácidas púrpuras (PAPs) juegan un papel clave en la asimilación y redistribución de fósforo (P) en las plantas, catalizando la hidrólisis de ésteres fosfato para producir fosfato inorgánico (Pi). En este estudio, se identificaron un total de 77 genes. Los genes candidatos se dividieron en tres grupos y diez subgrupos basados en los análisis filogenéticos y la organización de exones e intrones. Entre estas 77 proteínas BnaPAP, 35 exhiben residuos típicos de unión a metales característicos de las PAPs conocidas, mientras que ciertos residuos de aminoácidos no alterados estaban ausentes o desplazados en otras BnaPAPs. Se realizó una predicción computacional, revelando que la mayoría de las PAPs contienen motivos de péptido señal y muestran una variedad de niveles de N-glicosilación, así como motivos de hélice transmembrana. Un análisis de datos de RNA-seq obtenidos previamente reveló que el 55.84% (43 de 77) respondieron a la deficiencia de Pi. Además, realizamos un examen preliminar de los perfiles de expresión de genes en respuesta al estrés salino, y descubrimos que el 42.86% (33 de 77) de estos genes fueron inducidos bajo estrés salino, ya sea en los brotes o en las raíces. Análisis adicionales de qRT-PCR y GUS revelaron que, dos parálagos de, fueron inducidos por la deficiencia de Pi. Notablemente, exhibe una inducción robusta, en comparación con la inducción relativamente leve observada en. Nuestra investigación muestra que responde de manera única al estrés de Pi a través de la caja W, mientras que predominantemente responde a través del elemento P1BS, y las diferencias en los elementos reguladores (CREs) dentro de sus regiones promotoras contribuyen específicamente a sus distintos niveles de expresión bajo estrés de Pi. Nuestros hallazgos proporcionan valiosos conocimientos y establecen una base para futuros estudios funcionales de.