La biodiversidad es crucial para el funcionamiento de los ecosistemas, pero está disminuyendo rápidamente debido a las actividades humanas y al cambio climático. Proteger la biodiversidad se ha convertido en una prioridad clave para las acciones de conservación ambiental a nivel global. Las especies raras y en peligro de extinción tienen un gran impacto en el ecosistema, pero debido a su limitada capacidad de supervivencia, son más propensas a la extinción, lo que ejerce un impacto significativo en la biodiversidad. Sin embargo, la investigación actual revela una falta de información sobre la distribución potencial y los cambios de estas especies. Este estudio utilizó el modelo de máxima entropía para predecir los hábitats potenciales presentes y futuros de especies raras y en peligro de extinción en la provincia de Yunnan. Después de superponer los resultados del modelo, se dividieron cuatro regiones de riqueza mediante el método de punto de ruptura natural y se analizaron. Se compararon las áreas protegidas existentes con los puntos críticos, y también se analizó la composición del uso del suelo de los puntos críticos. Los resultados revelaron que, tanto en escenarios actuales como futuros, las especies raras y en peligro de extinción en la provincia de Yunnan se encuentran principalmente en la región montañosa occidental, en el área de alta temperatura de Xishuangbanna-Wenshan y en el área de densa cobertura vegetal de Kunming-Qujing. Estas especies también están expandiendo su distribución hacia la zona montañosa occidental. Sin embargo, bajo el escenario de bajas emisiones de carbono (RCP2.6), estas especies se dispersarán desde las regiones de alta abundancia hacia los puntos críticos de baja altitud para 2070. En el escenario de altas emisiones de carbono (RCP8.5), habrá menos áreas de alta abundancia en 2070 que en 2050. El análisis de la matriz de transferencia revela variaciones regionales en la riqueza a lo largo del tiempo. Además, el análisis reveló importantes brechas de conservación y encontró que las áreas de puntos críticos existentes estaban fuertemente afectadas por las actividades humanas. Para mejorar la eficiencia de la conservación, es necesario fortalecer la protección de los puntos críticos existentes en la provincia de Yunnan. El cambio climático juega un papel significativo en la migración de especies, siendo los niveles de precipitación un factor clave. Se deben tomar las acciones necesarias para abordar la protección insuficiente, resolver los conflictos entre las actividades humanas y el uso del suelo en áreas críticas, y formular estrategias efectivas para adaptarse a los futuros cambios climáticos. La provincia de Yunnan, con sus ricos recursos de especies, tiene el potencial de convertirse en un innovador global en la conservación de la biodiversidad mediante la implementación de estrategias de conservación mejoradas.