El epitelio corneal (EC) se extiende entre dos dominios, el limbo vascularizado externo y la córnea avascular propiamente dicha. Las células epiteliales sufren una migración constante desde el limbo hacia la córnea central, crítica para la visión. Coordinada con esta migración, las células experimentan cambios de diferenciación donde un grupo de células madre/precursoras únicas en el limbo produce las células maduras que alcanzan el centro corneal. La diferenciación se anuncia con la expresión de Krt12, específico de la córnea. El procesamiento de datos adquiridos por scRNA-Seq mostró que el aumento en la expresión de Krt12 ocurre en cuatro pasos distintos dentro del limbo, además de un aumento continuo en la córnea. El análisis diferencial de genes demostró que estos dominios reflejan etapas discretas de diferenciación del EC y proporcionaron información extensa sobre los genes que sufren regulación a la baja o al alza en la transición secuencial de condiciones menos a más diferenciadas. El enfoque permitió la identificación de múltiples cohortes de genes, incluyendo (a) los genes que tienen una expresión máxima en la cohorte de células más primitivas, negativas para Krt12, que probablemente incluya las células madre/precursoras; (b) los conjuntos de genes que experimentan un aumento o disminución continua a lo largo de todo el camino de diferenciación; y (c) los genes que muestran una correlación positiva o negativa máxima con los cambios en Krt12.