El orégano rojo L. subsp. es nativo de las laderas montañosas de Albania, prosperando a altitudes que van desde 400 a 1300 m sobre el nivel del mar. Los componentes aéreos del orégano se han encontrado que abordan un espectro de problemas de salud. Sin embargo, esta subespecie presenta características intrigantes que requieren exploración y análisis exhaustivos. Este estudio analiza extensamente la colección ex-situ de varias poblaciones de genotipos de orégano rojo en Albania. Los aceites esenciales fueron extraídos empleando el método de hidrodestilación. Al mismo tiempo, se llevaron a cabo análisis químicos utilizando cromatografía de gases acoplada con un detector de ionización de llama (GC-FID) y cromatografía de gases acoplada con un detector de espectrómetro de masas (GS-MS). Empleamos dos técnicas estadísticas, a saber, análisis jerárquico de conglomerados (HCA) y análisis de componentes principales (PCA), que permitieron un examen exhaustivo de las relaciones dentro del conjunto de datos y obtener conocimientos más profundos sobre los patrones de composición e interrelaciones dentro de los aceites esenciales. Los resultados revelaron distinciones cualitativas significativas a nivel intraespecífico, especialmente para sesquiterpenos, de poblaciones originarias de siete ubicaciones geográficas diversas. Los hallazgos del estudio mejoran nuestra comprensión de la composición química del orégano rojo de Albania y su variación química entre diferentes poblaciones, lo que potencialmente contribuirá a identificar los clones más adecuados para programas de cría dentro de las poblaciones de orégano rojo.