Los rasgos relacionados con el rendimiento siempre han sido un tema de investigación candente en el mejoramiento del arroz, y las hojas funcionales afectan directamente la eficiencia fotosintética y el rendimiento del arroz. Por lo tanto, es de gran importancia explorar los genes relacionados con el tamaño y la forma de las hojas de arroz para mejorar la morfología de las hojas de arroz, la eficiencia fotosintética y el rendimiento. Este estudio detectó los loci de rasgos cuantitativos (QTLs) para la longitud, ancho, relación longitud-anchura y área de la hoja bandera de arroz y la segunda hoja en 393 accesiones del Proyecto del Genoma del Arroz 3000 (3KRGP) mediante genotipado de polimorfismos de un solo nucleótido de alta densidad. Como resultado, se detectaron 91 QTLs, entre los cuales se identificaron 5 genes candidatos. Además, también se investigaron las interacciones epistáticas que afectan a los rasgos relacionados con las hojas, lo que resultó en la identificación de 134 pares significativos de interacciones QTL por QTL (QQIs). Los resultados de este estudio proporcionan una base genética importante para la búsqueda de genes asociados con la forma de las hojas de arroz e información genética valiosa para el mejoramiento del arroz.