La vitalidad de la semilla es un indicador crucial que evalúa de manera integral la calidad de las semillas, reflejando la ventaja de crecimiento y el potencial de producción de las semillas, y tiene un efecto significativo en la resistencia al estrés de las semillas. Identificar y controlar los loci relacionados con la vitalidad de la semilla de trigo es esencial para acelerar las ganancias de rasgos genéticos. Aquí, realizamos un amplio estudio de asociación de genoma completo (GWAS, por sus siglas en inglés) para identificar varios loci cuantitativos significativos (QTLs) asociados con rasgos relacionados con la vitalidad de la semilla. Se utilizaron un total de 404 muestras de trigo con diversos antecedentes genéticos como materiales experimentales. Se identificaron veintiocho loci significativamente asociados con rasgos relacionados con la vitalidad de la semilla en trigo, distribuidos en los cromosomas 3A, 4A, 5B, 7A y 7B. Se descubrieron dos posibles loci novedosos que controlan la vitalidad de la semilla de trigo, con un total de 80 genes candidatos asociados con la vitalidad de la semilla ubicados en estos loci. Entre ellos, codifica un gen de proteína abundante en la embriogénesis tardía (LEA, por sus siglas en inglés), y codifica un gen de helicasa, ambos mostrando una expresión específica en las semillas y altamente correlacionados con la vitalidad de la semilla. En general, estos hallazgos proporcionan información valiosa para la futura aplicación de estos genes en la cría de trigo.