El análisis a nivel de cromosomas del genoma proporciona información sobre su inmunidad, crecimiento y longevidad
Autores: Liu, Xiaoli; Liu, Haiyang; Wang, Yakun; Li, Mingzhi; Ji, Liqin; Wang, Kaikuo; Wei, Chengqing; Li, Wei; Chen, Chen; Yu, Lingyun; Zhu, Xinping; Hong, Xiaoyou
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
El análisis a nivel de cromosomas del genoma proporciona información sobre su inmunidad, crecimiento y longevidad
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Tortuga gigante de caparazón blando asiática
China
Genoma
Genomas de vertebrados
Evolución
Conservación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
La tortuga gigante de caparazón blando asiática, (Trionychidae), es una de las tortugas acuáticas más grandes de China y fue designada como Animal Protegido de Primera Clase en China en 1989. Una investigación previa basada en una combinación de tecnologías de lectura corta de Illumina, lectura larga de PacBio y tecnologías de andamiaje Hi-C adquirió un genoma de alta calidad a nivel de cromosoma. En este estudio, el análisis genómico comparativo entre y otros 16 genomas de vertebrados indicó que las tortugas se separaron del ancestro de los arcosaurios hace aproximadamente 256.6 (intervalo de densidad posterior más alta del 95%, 263.6-251.9) millones de años (Mya) (Pérmico superior a Triásico) y que se separaron del ancestro de y aproximadamente 59.3 (intervalo de densidad posterior más alta del 95%, 64.3-54.3) Mya. Además, varios genes candidatos, como , , y asociados con la supresión de tumores, el crecimiento y la edad se expandieron, implicando sus posibles roles en la excepcional longevidad de las tortugas. Este nuevo ensamblaje a nivel de cromosoma tiene un importante valor científico en el estudio de la conservación de y también enriquece la investigación evolutiva de las especies de tortugas.
Descripción
La tortuga gigante de caparazón blando asiática, (Trionychidae), es una de las tortugas acuáticas más grandes de China y fue designada como Animal Protegido de Primera Clase en China en 1989. Una investigación previa basada en una combinación de tecnologías de lectura corta de Illumina, lectura larga de PacBio y tecnologías de andamiaje Hi-C adquirió un genoma de alta calidad a nivel de cromosoma. En este estudio, el análisis genómico comparativo entre y otros 16 genomas de vertebrados indicó que las tortugas se separaron del ancestro de los arcosaurios hace aproximadamente 256.6 (intervalo de densidad posterior más alta del 95%, 263.6-251.9) millones de años (Mya) (Pérmico superior a Triásico) y que se separaron del ancestro de y aproximadamente 59.3 (intervalo de densidad posterior más alta del 95%, 64.3-54.3) Mya. Además, varios genes candidatos, como , , y asociados con la supresión de tumores, el crecimiento y la edad se expandieron, implicando sus posibles roles en la excepcional longevidad de las tortugas. Este nuevo ensamblaje a nivel de cromosoma tiene un importante valor científico en el estudio de la conservación de y también enriquece la investigación evolutiva de las especies de tortugas.