Análisis conjunto de transcriptoma y metaboloma prevalece sobre los mecanismos biológicos subyacentes a la lucha pro-supervivencia en células de granulosa sometidas a estrés térmico in vitro
Autores: Sammad, Abdul; Luo, Hanpeng; Hu, Lirong; Zhao, Shanjiang; Gong, Jianfei; Umer, Saqib; Khan, Adnan; Zhu, Huabin; Wang, Yachun
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Análisis conjunto de transcriptoma y metaboloma prevalece sobre los mecanismos biológicos subyacentes a la lucha pro-supervivencia en células de granulosa sometidas a estrés térmico in vitro
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Transcriptoma
Metaboloma
Células de granulosa sometidas a estrés térmico
Metabolitos
Genes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
Estudios previos informaron sobre los cambios físicos, transcriptómicos y metabolómicos en células de granulosa bovina sometidas a estrés térmico agudo in vitro (38 grados C frente a 43 grados C durante 2 h). Las células de granulosa mostraron senescencia de proliferación transitoria, estrés oxidativo, una tasa aumentada de apoptosis y una disminución en la actividad esteroidogénica. En este estudio, realizamos un análisis conjunto de integración y red de datos metabolómicos y transcriptómicos para reducir y elucidar el papel de los genes expresados diferencialmente, metabolitos importantes y vías celulares y metabólicas relevantes en células de granulosa sometidas a estrés térmico agudo. Entre las vías metabólicas significativas (valor p < 0.05) donde convergieron metabolitos y genes, este estudio encontró el metabolismo de la vitamina B6, el metabolismo de glicina, serina y treonina, el metabolismo de fenilalanina, la biosíntesis de arginina, el metabolismo de triptófano, el metabolismo de arginina y prolina, el metabolismo de histidina y el metabolismo de glioxilato y dicarboxilato. Las vías biológicas convergentes significativas incluyeron transportadores ABC y digestión y absorción de proteínas, mientras que las vías de señalización funcional incluyeron las vías de señalización cAMP, mTOR y AMPK junto con la vía de esteroidogénesis ovárica. Entre las vías del cáncer, la más importante fue el metabolismo central del carbono en el cáncer. A través de múltiples consultas de análisis, se identificaron como metabolitos y genes importantes progesterona, serotonina, ácido cítrico, piridoxal, L-lisina, ácido succínico, L-glutamina, L-leucina, L-treonina, L-tirosina, vitamina B6, colina, y otros metabolitos enriquecidos. Estos genes, metabolitos y vías metabólicas, celulares y de señalización celular elucidaron de manera integral los mecanismos subyacentes a la compleja lucha entre la muerte y la supervivencia en células de granulosa bovina sometidas a estrés térmico agudo y, esencialmente, ayudan a avanzar en nuestra comprensión (y ayudarán en la futura búsqueda) de la investigación en esta dirección.
Descripción
Estudios previos informaron sobre los cambios físicos, transcriptómicos y metabolómicos en células de granulosa bovina sometidas a estrés térmico agudo in vitro (38 grados C frente a 43 grados C durante 2 h). Las células de granulosa mostraron senescencia de proliferación transitoria, estrés oxidativo, una tasa aumentada de apoptosis y una disminución en la actividad esteroidogénica. En este estudio, realizamos un análisis conjunto de integración y red de datos metabolómicos y transcriptómicos para reducir y elucidar el papel de los genes expresados diferencialmente, metabolitos importantes y vías celulares y metabólicas relevantes en células de granulosa sometidas a estrés térmico agudo. Entre las vías metabólicas significativas (valor p < 0.05) donde convergieron metabolitos y genes, este estudio encontró el metabolismo de la vitamina B6, el metabolismo de glicina, serina y treonina, el metabolismo de fenilalanina, la biosíntesis de arginina, el metabolismo de triptófano, el metabolismo de arginina y prolina, el metabolismo de histidina y el metabolismo de glioxilato y dicarboxilato. Las vías biológicas convergentes significativas incluyeron transportadores ABC y digestión y absorción de proteínas, mientras que las vías de señalización funcional incluyeron las vías de señalización cAMP, mTOR y AMPK junto con la vía de esteroidogénesis ovárica. Entre las vías del cáncer, la más importante fue el metabolismo central del carbono en el cáncer. A través de múltiples consultas de análisis, se identificaron como metabolitos y genes importantes progesterona, serotonina, ácido cítrico, piridoxal, L-lisina, ácido succínico, L-glutamina, L-leucina, L-treonina, L-tirosina, vitamina B6, colina, y otros metabolitos enriquecidos. Estos genes, metabolitos y vías metabólicas, celulares y de señalización celular elucidaron de manera integral los mecanismos subyacentes a la compleja lucha entre la muerte y la supervivencia en células de granulosa bovina sometidas a estrés térmico agudo y, esencialmente, ayudan a avanzar en nuestra comprensión (y ayudarán en la futura búsqueda) de la investigación en esta dirección.