Análisis comparativo del transcriptoma de cáscaras de berenjena ( L.) con diferente brillo
Autores: Wang, Hong; Nie, Zhixing; Wang, Tonglin; Yang, Shuhuan; Zheng, Jirong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis comparativo del transcriptoma de cáscaras de berenjena ( L.) con diferente brillo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Pelar el brillo
Berenjena
Genes
Transcriptomas
Genes diferencialmente expresados
Niveles de brillo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 27
Citaciones: Sin citaciones
El brillo de la cáscara es un rasgo comercial importante de la berenjena (S.). En este estudio, se utilizaron dos líneas endogámicas de berenjena con diferentes niveles de brillo en la cáscara para identificar genes relacionados con el brillo de la cáscara. El análisis de secciones de parafina mostró que el aumento del grosor de la cera y las arrugas en la superficie de la cera de las cáscaras de berenjena disminuyeron el brillo. La expresión génica diferencial relacionada con el brillo de la cáscara de berenjena se analizó comparando los transcriptomas de cáscaras de berenjena con diferentes niveles de brillo y en diferentes etapas de desarrollo. Los resultados identificaron 996 genes diferencialmente expresados (DEGs), incluidos 502 genes sobreexpresados y 494 genes subexpresados, posiblemente relacionados con el brillo de la cáscara de berenjena. Los análisis de enriquecimiento de GO y KEGG revelaron que la vía de replicación del ADN (GO:0003688, GO:0006270) y la vía de la fotosíntesis (map00195) estaban subexpresadas y, por lo tanto, podrían estar asociadas con la reducción del brillo de la cáscara de berenjena. El análisis del nivel de expresión de cáscaras de berenjena con diferentes niveles de brillo reveló que un gen de factor de transcripción C2H2, dos genes de factor de transcripción ERF, un gen de sintetasa de acil-CoA de cadena larga y cuatro genes relacionados con la cera o la cutina podrían estar asociados con el brillo de las cáscaras de frutas de berenjena. Estos hallazgos ayudarán a guiar futuras mejoras genéticas en el brillo de la cáscara de berenjena.
Descripción
El brillo de la cáscara es un rasgo comercial importante de la berenjena (S.). En este estudio, se utilizaron dos líneas endogámicas de berenjena con diferentes niveles de brillo en la cáscara para identificar genes relacionados con el brillo de la cáscara. El análisis de secciones de parafina mostró que el aumento del grosor de la cera y las arrugas en la superficie de la cera de las cáscaras de berenjena disminuyeron el brillo. La expresión génica diferencial relacionada con el brillo de la cáscara de berenjena se analizó comparando los transcriptomas de cáscaras de berenjena con diferentes niveles de brillo y en diferentes etapas de desarrollo. Los resultados identificaron 996 genes diferencialmente expresados (DEGs), incluidos 502 genes sobreexpresados y 494 genes subexpresados, posiblemente relacionados con el brillo de la cáscara de berenjena. Los análisis de enriquecimiento de GO y KEGG revelaron que la vía de replicación del ADN (GO:0003688, GO:0006270) y la vía de la fotosíntesis (map00195) estaban subexpresadas y, por lo tanto, podrían estar asociadas con la reducción del brillo de la cáscara de berenjena. El análisis del nivel de expresión de cáscaras de berenjena con diferentes niveles de brillo reveló que un gen de factor de transcripción C2H2, dos genes de factor de transcripción ERF, un gen de sintetasa de acil-CoA de cadena larga y cuatro genes relacionados con la cera o la cutina podrían estar asociados con el brillo de las cáscaras de frutas de berenjena. Estos hallazgos ayudarán a guiar futuras mejoras genéticas en el brillo de la cáscara de berenjena.