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Análisis comparativo del ADN mitocondrial reveló dos estructuras genómicas distintas

Autores: Li, Jin; Cullis, Christopher

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Análisis comparativo del ADN mitocondrial reveló dos estructuras genómicas distintas


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Frijol marama
Mitogenomas
Polimorfismos de un solo nucleótido
Inserciones/borrados
Heteroplasmia
Análisis evolutivo

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 17

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
comúnmente conocida como la haba marama, es una legumbre subutilizada con semillas nutritivas, que tiene el potencial de mejorar la seguridad alimentaria en el sur de África debido a su resistencia a sequías prolongadas y calor. Para promover la selección de este germoplasma agronómicamente valioso, este estudio reunió y comparó los mitogenomas de 84 individuos de marama, identificando variaciones en la estructura del genoma, polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), inserciones/deleciones (indels), heteroplasmia y transferencia horizontal. Se identificaron dos germoplasmas distintos, y se descubrió una nueva estructura de mitogenoma que consiste en tres moléculas circulares y un cromosoma lineal largo. La variación estructural llevó a un aumento en el número de copias de genes específicos. Los dos mitogenomas también mostraron diferencias en 230 loci, con solo una sustitución no sinónima notable en el gen. La heteroplasmia se concentró en ciertos loci en el cromosoma LS1 (OK638188). Además, el mitogenoma de marama contenía una inserción de más de 9 kb de cpDNA, originada de genomas de cloroplastos, pero había acumulado mutaciones y perdido funcionalidad génica. El análisis evolutivo y de genómica comparativa indicó que la divergencia del mitogenoma en marama podría no estar únicamente restringida por factores geográficos. Además, la marama, como miembro de la subfamilia Cercidoideae, tiende a poseer un conjunto más completo de genes mitocondriales que las legumbres Faboideae.

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