Análisis comparativo de la familia de genes en Gramineae
Autores: Liang, Zicong; Shi, Shuai; Xue, Baoping; Li, Dongyang; Liu, Yue; Liu, Chang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Análisis comparativo de la familia de genes en Gramineae
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Factor de transcripción
TALE
Familia de genes
Especies de Gramíneas
Identificación de genoma completo
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 26
Citaciones: Sin citaciones
El factor de transcripción conocido como TALE (extensión de bucle de tres aminoácidos) es esencial para el crecimiento de las plantas, la diferenciación celular y las respuestas a los estreses ambientales. Aunque la familia de genes ha sido identificada en varias plantas, ha habido una falta de identificación y análisis exhaustivo de genomas completos en especies de Gramineae. En este estudio, se identificaron 123 genes de familia en cinco especies de Gramineae, que pueden categorizarse en dos subgrupos principales: KONX y BELL. La mayoría de los genes en el mismo subgrupo mostraron estructuras génicas análogas y motivos conservados. Además, la duplicación de genomas completos (WGD, por sus siglas en inglés) contribuye significativamente a la expansión de la familia de genes en Gramineae. La región promotora de los genes en Gramineae contiene un gran número de elementos cis asociados con el estrés abiótico y la respuesta hormonal. El análisis de la expresión específica de tejidos indicó que la mayoría de los genes estaban altamente expresados en tallos y hojas. Además, los datos de RNA-seq revelaron que los genes respondieron a tratamientos de estrés abiótico. Además, encontramos que los niveles de expresión fueron regulados al alza en respuesta al tratamiento con PEG y NaCl, respectivamente. Este estudio proporciona una referencia significativa para futuras investigaciones sobre la función biológica de los factores de transcripción TALE en plantas de Gramineae.
Descripción
El factor de transcripción conocido como TALE (extensión de bucle de tres aminoácidos) es esencial para el crecimiento de las plantas, la diferenciación celular y las respuestas a los estreses ambientales. Aunque la familia de genes ha sido identificada en varias plantas, ha habido una falta de identificación y análisis exhaustivo de genomas completos en especies de Gramineae. En este estudio, se identificaron 123 genes de familia en cinco especies de Gramineae, que pueden categorizarse en dos subgrupos principales: KONX y BELL. La mayoría de los genes en el mismo subgrupo mostraron estructuras génicas análogas y motivos conservados. Además, la duplicación de genomas completos (WGD, por sus siglas en inglés) contribuye significativamente a la expansión de la familia de genes en Gramineae. La región promotora de los genes en Gramineae contiene un gran número de elementos cis asociados con el estrés abiótico y la respuesta hormonal. El análisis de la expresión específica de tejidos indicó que la mayoría de los genes estaban altamente expresados en tallos y hojas. Además, los datos de RNA-seq revelaron que los genes respondieron a tratamientos de estrés abiótico. Además, encontramos que los niveles de expresión fueron regulados al alza en respuesta al tratamiento con PEG y NaCl, respectivamente. Este estudio proporciona una referencia significativa para futuras investigaciones sobre la función biológica de los factores de transcripción TALE en plantas de Gramineae.