Análisis combinado de transcriptoma y metaboloma de la respuesta al estrés de PEG
Autores: Chai, Shujie; Dong, Wenke; Ma, Huiling
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis combinado de transcriptoma y metaboloma de la respuesta al estrés de PEG
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Estrés por sequía
Secuenciación del transcriptoma
Análisis del metaboloma
Regulación génica
Metabolitos
Mejoramiento molecular
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 22
Citaciones: Sin citaciones
El estrés por sequía es un estrés abiótico común y presenta una fuerte adaptabilidad, pero su mecanismo de resistencia a la sequía no ha sido explorado. Este estudio utilizó PEG-6000 para simular el estrés por sequía, y se determinaron el contenido de HO, la tasa de generación de O y el contenido de MDA. También se llevaron a cabo análisis de secuenciación del transcriptoma y metaboloma no dirigido en un germoplasma de Islandia y un germoplasma de América B bajo diferentes duraciones de estrés por sequía. Los resultados mostraron que el rango de regulación génica en el germoplasma de América B fue mayor, ya sea que los genes estuvieran sobreexpresados o subexpresados. Y el número de genes en el germoplasma de América B fue mayor que en el germoplasma de Islandia. Además, el germoplasma de Islandia produjo menos peróxido bajo estrés de PEG que el germoplasma de América B. El germoplasma de Islandia fue más estable que el germoplasma de América B bajo estrés de PEG, lo cual se puede observar en dos aspectos: contenido de peróxido y cantidad de regulación génica. El análisis conjunto de transcriptómica y metabolómica mostró que los genes y metabolitos relacionados con el metabolismo secundario y del carbono estuvieron principalmente involucrados en la respuesta al estrés por sequía simulado con PEG. Los metabolitos incluyeron principalmente fenilalanina, tirosina, trans-2-hidroxicinamato, sintasa de almidón, enzima de ramificación de 1,4-alfa glucano y fosforilasa de glucógeno, y los genes principalmente incluyeron , , , , y . Estos resultados proporcionaron recursos genéticos y una base teórica para futuros cruces moleculares de .
Descripción
El estrés por sequía es un estrés abiótico común y presenta una fuerte adaptabilidad, pero su mecanismo de resistencia a la sequía no ha sido explorado. Este estudio utilizó PEG-6000 para simular el estrés por sequía, y se determinaron el contenido de HO, la tasa de generación de O y el contenido de MDA. También se llevaron a cabo análisis de secuenciación del transcriptoma y metaboloma no dirigido en un germoplasma de Islandia y un germoplasma de América B bajo diferentes duraciones de estrés por sequía. Los resultados mostraron que el rango de regulación génica en el germoplasma de América B fue mayor, ya sea que los genes estuvieran sobreexpresados o subexpresados. Y el número de genes en el germoplasma de América B fue mayor que en el germoplasma de Islandia. Además, el germoplasma de Islandia produjo menos peróxido bajo estrés de PEG que el germoplasma de América B. El germoplasma de Islandia fue más estable que el germoplasma de América B bajo estrés de PEG, lo cual se puede observar en dos aspectos: contenido de peróxido y cantidad de regulación génica. El análisis conjunto de transcriptómica y metabolómica mostró que los genes y metabolitos relacionados con el metabolismo secundario y del carbono estuvieron principalmente involucrados en la respuesta al estrés por sequía simulado con PEG. Los metabolitos incluyeron principalmente fenilalanina, tirosina, trans-2-hidroxicinamato, sintasa de almidón, enzima de ramificación de 1,4-alfa glucano y fosforilasa de glucógeno, y los genes principalmente incluyeron , , , , y . Estos resultados proporcionaron recursos genéticos y una base teórica para futuros cruces moleculares de .