Identificación bioinformática y análisis de expresión de la familia de genes MAPK-MAP4K revelan una posible cascada funcional MAP4K10-MAP3K7/8-MAP2K1/11-MAPK3/6 en trigo (L.)
Autores: Li, Yongliang; Li, You; Zou, Xiaoxiao; Jiang, Shuai; Cao, Miyuan; Chen, Fenglin; Yin, Yan; Xiao, Wenjun; Liu, Shucan; Guo, Xinhong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación bioinformática y análisis de expresión de la familia de genes MAPK-MAP4K revelan una posible cascada funcional MAP4K10-MAP3K7/8-MAP2K1/11-MAPK3/6 en trigo (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Quinasa activada por mitógenos
Crecimiento de plantas
Estrés abiótico
Trigo
Módulos de señalización
Resistencia a la sequía
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
Las cascadas de quinasa activada por mitógenos (MAPK) actúan como módulos de señalización cruciales que regulan el crecimiento y desarrollo de las plantas, la respuesta a estrés biótico/abiótico y la inmunidad vegetal. Los MAP3Ks pueden ser activados a través de la fosforilación en sistemas no vegetales, pero esto no se ha reportado en plantas hasta la fecha. Aquí, identificamos un total de 234 miembros putativos de la familia TaMAPK en trigo (L.). Incluyeron 48, 17, 144 y 25. Realizamos análisis sistemáticos de la evolución, conservación de dominios, redes de interacción y perfiles de expresión de estos miembros de la familia de quinasas (representando, , , y ). Los 234 están distribuidos en 21 cromosomas y un grupo de enlace desconocido (Un). Notablemente, 25 de estos miembros de la familia poseían los motivos conservados de los genes, incluyendo el motivo rico en glicina, el motivo de lisina invariable (K), el motivo HRD, el motivo DFG y el motivo de firma. y, y / se mostraron fuertemente expresados no solo a lo largo de las etapas de crecimiento y desarrollo, sino también en respuesta al estrés por sequía o calor. Los análisis bioinformáticos y los resultados de qRT-PCR sugirieron que el trigo puede activar la vía MAP4K10-MEKK7-MAP2K11-MAPK6 para aumentar la resistencia a la sequía en trigo, y la vía MAP4K10-MAP3K8-MAP2K1/11-MAPK3 puede estar involucrada en el crecimiento de las plantas. En general, nuestro trabajo identificó miembros de la cascada MAPK-MAP4K en trigo y perfiló sus posibles roles durante su respuesta a estrés abiótico y crecimiento de las plantas basado en su patrón de expresión. Las cascadas caracterizadas podrían ser buenos candidatos para futuras mejoras de cultivos y cría molecular.
Descripción
Las cascadas de quinasa activada por mitógenos (MAPK) actúan como módulos de señalización cruciales que regulan el crecimiento y desarrollo de las plantas, la respuesta a estrés biótico/abiótico y la inmunidad vegetal. Los MAP3Ks pueden ser activados a través de la fosforilación en sistemas no vegetales, pero esto no se ha reportado en plantas hasta la fecha. Aquí, identificamos un total de 234 miembros putativos de la familia TaMAPK en trigo (L.). Incluyeron 48, 17, 144 y 25. Realizamos análisis sistemáticos de la evolución, conservación de dominios, redes de interacción y perfiles de expresión de estos miembros de la familia de quinasas (representando, , , y ). Los 234 están distribuidos en 21 cromosomas y un grupo de enlace desconocido (Un). Notablemente, 25 de estos miembros de la familia poseían los motivos conservados de los genes, incluyendo el motivo rico en glicina, el motivo de lisina invariable (K), el motivo HRD, el motivo DFG y el motivo de firma. y, y / se mostraron fuertemente expresados no solo a lo largo de las etapas de crecimiento y desarrollo, sino también en respuesta al estrés por sequía o calor. Los análisis bioinformáticos y los resultados de qRT-PCR sugirieron que el trigo puede activar la vía MAP4K10-MEKK7-MAP2K11-MAPK6 para aumentar la resistencia a la sequía en trigo, y la vía MAP4K10-MAP3K8-MAP2K1/11-MAPK3 puede estar involucrada en el crecimiento de las plantas. En general, nuestro trabajo identificó miembros de la cascada MAPK-MAP4K en trigo y perfiló sus posibles roles durante su respuesta a estrés abiótico y crecimiento de las plantas basado en su patrón de expresión. Las cascadas caracterizadas podrían ser buenos candidatos para futuras mejoras de cultivos y cría molecular.