Perspectivas sobre el análisis bioinformático y transcripcional de la familia de genes de los complejos Elongator () del trigo: Contribuyen a la tolerancia del trigo al estrés abiótico y a la senescencia de las hojas
Autores: Guo, Feng; Islam, Md Ashraful; Lv, Chenxu; Jin, Xiujuan; Sun, Lili; Zhao, Kai; Lu, Juan; Yan, Rongyue; Zhang, Wenjun; Shi, Yugang; Li, Ning; Sun, Daizhen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Perspectivas sobre el análisis bioinformático y transcripcional de la familia de genes de los complejos Elongator () del trigo: Contribuyen a la tolerancia del trigo al estrés abiótico y a la senescencia de las hojas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Complejos
Transcripción
Genes
Estrés
Trigo
Regulador
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los complejos elongadores son los complejos proteicos que promueven la transcripción a través de la acetilación de histonas en células eucariotas e interactúan con la ARN polimerasa II (RNAPII) en elongación. Su papel en el crecimiento y desarrollo de las plantas, la transducción de señales y la respuesta a estrés biótico y abiótico ha sido confirmado en plantas modelo. Sin embargo, las funciones de los genes de trigo no están bien documentadas. El presente estudio identificó 18 miembros del genoma de trigo mediante una búsqueda de homología. Además, se analizaron patrones de bioinformática y transcripción en respuesta a diferentes condiciones de estrés para desentrañar sus posibles mecanismos regulatorios en el trigo. El análisis de duplicación de genes mostró que 18 pares de genes paralogos se derivaron de duplicación segmentaria, que se dividió en seis clados mediante análisis filogenético de proteínas y análisis de clúster. El análisis ortólogo de los genes de trigo mostró que los genes pueden haber evolucionado a partir de genes ortólogos de otras especies de plantas o plantas estrechamente relacionadas. Además, se identificaron una variedad de elementos reguladores cis-actuantes (CAREs) relacionados con el crecimiento y desarrollo, la respuesta hormonal y los estrés bióticos y abióticos en las regiones promotoras. El análisis de qRT-PCR mostró que la transcripción se indujo bajo estrés hormonal, salino y de sequía y durante la senescencia de las hojas. El gen fue silenciado con BSMV-VIGS y se verificó preliminarmente que estaba involucrado en la regulación de la senescencia de las hojas de trigo. En general, los genes podrían estar regulados por vías de señalización hormonal y respuesta al estrés abiótico y a la senescencia de las hojas, lo que podría investigarse más a fondo como posibles genes candidatos para la tolerancia al estrés abiótico del trigo y la mejora del rendimiento.
Descripción
Los complejos elongadores son los complejos proteicos que promueven la transcripción a través de la acetilación de histonas en células eucariotas e interactúan con la ARN polimerasa II (RNAPII) en elongación. Su papel en el crecimiento y desarrollo de las plantas, la transducción de señales y la respuesta a estrés biótico y abiótico ha sido confirmado en plantas modelo. Sin embargo, las funciones de los genes de trigo no están bien documentadas. El presente estudio identificó 18 miembros del genoma de trigo mediante una búsqueda de homología. Además, se analizaron patrones de bioinformática y transcripción en respuesta a diferentes condiciones de estrés para desentrañar sus posibles mecanismos regulatorios en el trigo. El análisis de duplicación de genes mostró que 18 pares de genes paralogos se derivaron de duplicación segmentaria, que se dividió en seis clados mediante análisis filogenético de proteínas y análisis de clúster. El análisis ortólogo de los genes de trigo mostró que los genes pueden haber evolucionado a partir de genes ortólogos de otras especies de plantas o plantas estrechamente relacionadas. Además, se identificaron una variedad de elementos reguladores cis-actuantes (CAREs) relacionados con el crecimiento y desarrollo, la respuesta hormonal y los estrés bióticos y abióticos en las regiones promotoras. El análisis de qRT-PCR mostró que la transcripción se indujo bajo estrés hormonal, salino y de sequía y durante la senescencia de las hojas. El gen fue silenciado con BSMV-VIGS y se verificó preliminarmente que estaba involucrado en la regulación de la senescencia de las hojas de trigo. En general, los genes podrían estar regulados por vías de señalización hormonal y respuesta al estrés abiótico y a la senescencia de las hojas, lo que podría investigarse más a fondo como posibles genes candidatos para la tolerancia al estrés abiótico del trigo y la mejora del rendimiento.