Antecedentes: (anteriormente llamado) ha sido descuidado durante años en Tailandia. El estudio genómico de ha ganado mucha atención recientemente tras la publicación del primer genoma de referencia de alta calidad del aislado LSCM4. El enfoque integrador de múltiples plataformas de secuenciación para la secuenciación de genomas completos ha demostrado ser efectivo a expensas de costos considerablemente altos. Este estudio presenta un flujo de trabajo bioinformático preliminar que incluye el uso de ensamblaje de novo en múltiples pasos junto con el método de ensamblaje basado en referencia para producir borradores genómicos de alta calidad a partir de los datos de secuenciación de lectura corta de Illumina del aislado PCM2. Resultados: La integración del ensamblaje de novo en múltiples pasos mediante MEGAHIT y SPAdes con el método basado en referencia utilizando el genoma y recuperando las lecturas no mapeadas resultó en el borrador genómico de 30.27 Mb del aislado PCM2 con 3367 contigs y 8887 genes predichos. Los resultados del enfoque integrado mostraron la mejor integridad, cobertura y alineación de contigs en comparación con el genoma del aislado LSCM4 recolectado de la provincia norte de Tailandia. Se observaron patrones similares de proporciones y frecuencias de genes a partir de la anotación del proceso biológico GO. Se asignaron cincuenta términos GO a los genomas ensamblados, y 23 de estos (que representan el 61.6% de los genes anotados) mostraron mayores conteos y proporciones de genes cuando se compararon los resultados de nuestro flujo de trabajo con los del aislado LSCM4. Conclusiones: Estos resultados indicaron que nuestro flujo de trabajo bioinformático propuesto produjo un genoma de calidad aceptable de la cepa PCM2 para análisis genómicos funcionales, maximizando el uso de los datos de lectura corta. Este flujo de trabajo proporcionaría información extensa necesaria para identificar marcadores específicos de cepa y genes asociados a la virulencia útiles para el desarrollo de medicamentos y vacunas antes de una investigación más exhaustiva y costosa.