Análisis basado en el genoma de los clústeres de genes de sintasas de poliketidos
Autores: Sayari, Mohammad; Dolatabadian, Aria; El-Shetehy, Mohamed; Rehal, Pawanpuneet Kaur; Daayf, Fouad
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Análisis basado en el genoma de los clústeres de genes de sintasas de poliketidos
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Poliquétidos
Hongos
Biosíntesis
Grupos de genes
Especies
Compuestos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 33
Citaciones: Sin citaciones
Los poliketidos son metabolitos secundarios estructuralmente diversos y fisiológicamente activos producidos por muchos organismos, incluidos los hongos. La biosíntesis de poliketidos a partir de tioésteres de acilo-CoA es catalizada por las poliketido sintasas, PKS. Los poliketidos desempeñan roles que incluyen la protección celular contra el estrés oxidativo, roles no constitutivos (tóxicos) en las membranas celulares y la promoción de la supervivencia de los organismos hospedadores. El género comprende muchas especies que afectan a una amplia gama de organismos, incluidos plantas, insectos y otros hongos. Muchos son conocidos como agentes causales de enfermedades de marchitez en plantas. En este estudio, un enfoque de genómica comparativa que involucra varias especies nos llevó a evaluar el potencial de las especies para producir poliketidos e identificar posibles grupos de genes de biosíntesis de poliketidos. El siguiente paso fue caracterizarlos y predecir los tipos de compuestos de poliketidos que podrían producir. Utilizamos secuencias disponibles públicamente de diez especies para identificar y caracterizar grupos de genes PKS mediante una variedad de enfoques bioinformáticos y filogenéticos. Encontramos 32 genes PKS putativos y posibles grupos en los genomas de las especies. Todos los grupos parecen ser completos y funcionales. Además, al menos cinco grupos, incluidos compuestos putativos como DHN-melanina, citochalásico, fusarielina, fujicurina y compuestos similares a lijiquinona, pueden pertenecer al repertorio activo de PKS. Estos resultados abrirán el camino para estudios funcionales adicionales para comprender el papel de estos grupos.
Descripción
Los poliketidos son metabolitos secundarios estructuralmente diversos y fisiológicamente activos producidos por muchos organismos, incluidos los hongos. La biosíntesis de poliketidos a partir de tioésteres de acilo-CoA es catalizada por las poliketido sintasas, PKS. Los poliketidos desempeñan roles que incluyen la protección celular contra el estrés oxidativo, roles no constitutivos (tóxicos) en las membranas celulares y la promoción de la supervivencia de los organismos hospedadores. El género comprende muchas especies que afectan a una amplia gama de organismos, incluidos plantas, insectos y otros hongos. Muchos son conocidos como agentes causales de enfermedades de marchitez en plantas. En este estudio, un enfoque de genómica comparativa que involucra varias especies nos llevó a evaluar el potencial de las especies para producir poliketidos e identificar posibles grupos de genes de biosíntesis de poliketidos. El siguiente paso fue caracterizarlos y predecir los tipos de compuestos de poliketidos que podrían producir. Utilizamos secuencias disponibles públicamente de diez especies para identificar y caracterizar grupos de genes PKS mediante una variedad de enfoques bioinformáticos y filogenéticos. Encontramos 32 genes PKS putativos y posibles grupos en los genomas de las especies. Todos los grupos parecen ser completos y funcionales. Además, al menos cinco grupos, incluidos compuestos putativos como DHN-melanina, citochalásico, fusarielina, fujicurina y compuestos similares a lijiquinona, pueden pertenecer al repertorio activo de PKS. Estos resultados abrirán el camino para estudios funcionales adicionales para comprender el papel de estos grupos.