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Análisis basado en el genoma de los clústeres de genes de sintasas de poliketidos

Autores: Sayari, Mohammad; Dolatabadian, Aria; El-Shetehy, Mohamed; Rehal, Pawanpuneet Kaur; Daayf, Fouad

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2022

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Acceso abierto

Artículo científico
2022

Análisis basado en el genoma de los clústeres de genes de sintasas de poliketidos


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Poliquétidos
Hongos
Biosíntesis
Grupos de genes
Especies
Compuestos

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 33

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Los poliketidos son metabolitos secundarios estructuralmente diversos y fisiológicamente activos producidos por muchos organismos, incluidos los hongos. La biosíntesis de poliketidos a partir de tioésteres de acilo-CoA es catalizada por las poliketido sintasas, PKS. Los poliketidos desempeñan roles que incluyen la protección celular contra el estrés oxidativo, roles no constitutivos (tóxicos) en las membranas celulares y la promoción de la supervivencia de los organismos hospedadores. El género comprende muchas especies que afectan a una amplia gama de organismos, incluidos plantas, insectos y otros hongos. Muchos son conocidos como agentes causales de enfermedades de marchitez en plantas. En este estudio, un enfoque de genómica comparativa que involucra varias especies nos llevó a evaluar el potencial de las especies para producir poliketidos e identificar posibles grupos de genes de biosíntesis de poliketidos. El siguiente paso fue caracterizarlos y predecir los tipos de compuestos de poliketidos que podrían producir. Utilizamos secuencias disponibles públicamente de diez especies para identificar y caracterizar grupos de genes PKS mediante una variedad de enfoques bioinformáticos y filogenéticos. Encontramos 32 genes PKS putativos y posibles grupos en los genomas de las especies. Todos los grupos parecen ser completos y funcionales. Además, al menos cinco grupos, incluidos compuestos putativos como DHN-melanina, citochalásico, fusarielina, fujicurina y compuestos similares a lijiquinona, pueden pertenecer al repertorio activo de PKS. Estos resultados abrirán el camino para estudios funcionales adicionales para comprender el papel de estos grupos.

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