Análisis basado en el genoma de la potencial bioactividad de la cepa terrestre AC-40
Autores: Sedeek, Abdelrahman M.; Salah, Israa; Kamel, Hasnaa L.; Soltan, Mohamed A.; Nour, Eman; Alshammari, Abdulrahman; Riaz Rajoka, Muhammad Shahid; Elsayed, Tarek R.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis basado en el genoma de la potencial bioactividad de la cepa terrestre AC-40
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Fábricas
Metabolitos secundarios antimicrobianos
Análisis genómico
Grupos de genes de metabolitos secundarios
Características promotoras del crecimiento de plantas
Análisis del pan-genoma
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
son fábricas de metabolitos secundarios antimicrobianos. Aislamos una especie asociada con la rizósfera. Su extracto metabólico total exhibió potentes propiedades antibacterianas y antifúngicas contra todos los microbios patógenos probados. Se realizaron secuenciación del genoma completo y análisis genómicos para observar sus principales características y reconstruir las vías metabólicas que pueden estar asociadas con rasgos útiles biotecnológicamente. Se utilizó AntiSMASH para identificar los grupos de genes de metabolitos secundarios. Además, buscamos genes conocidos asociados con características de promoción del crecimiento de plantas. Finalmente, se llevó a cabo un análisis comparativo y de pan-genoma con tres genomas estrechamente relacionados. Se identificó como la cepa AC-40. La minería del genoma indicó la presencia de varios grupos de genes de metabolitos secundarios. Algunos de ellos son idénticos o homólogos a grupos de genes de metabolitos conocidos con actividades antimicrobianas, antioxidantes y otras bioactividades. También mostró la presencia de varios genes relacionados con rasgos de promoción del crecimiento de plantas. El análisis comparativo del genoma indicó que al menos cinco de estos grupos de genes están altamente conservados a través de los genomas del grupo rochei. Las características genotípicas y fenotípicas de la cepa AC-40 indican que es una fuente prometedora de metabolitos secundarios beneficiosos con aplicaciones farmacéuticas y biotecnológicas.
Descripción
son fábricas de metabolitos secundarios antimicrobianos. Aislamos una especie asociada con la rizósfera. Su extracto metabólico total exhibió potentes propiedades antibacterianas y antifúngicas contra todos los microbios patógenos probados. Se realizaron secuenciación del genoma completo y análisis genómicos para observar sus principales características y reconstruir las vías metabólicas que pueden estar asociadas con rasgos útiles biotecnológicamente. Se utilizó AntiSMASH para identificar los grupos de genes de metabolitos secundarios. Además, buscamos genes conocidos asociados con características de promoción del crecimiento de plantas. Finalmente, se llevó a cabo un análisis comparativo y de pan-genoma con tres genomas estrechamente relacionados. Se identificó como la cepa AC-40. La minería del genoma indicó la presencia de varios grupos de genes de metabolitos secundarios. Algunos de ellos son idénticos o homólogos a grupos de genes de metabolitos conocidos con actividades antimicrobianas, antioxidantes y otras bioactividades. También mostró la presencia de varios genes relacionados con rasgos de promoción del crecimiento de plantas. El análisis comparativo del genoma indicó que al menos cinco de estos grupos de genes están altamente conservados a través de los genomas del grupo rochei. Las características genotípicas y fenotípicas de la cepa AC-40 indican que es una fuente prometedora de metabolitos secundarios beneficiosos con aplicaciones farmacéuticas y biotecnológicas.