Los aminoácidos son bloques de construcción de proteínas que son componentes esenciales de una amplia gama de vías metabólicas en especies de plantas, incluidas las especies de arroz. Estudios anteriores solo consideraron los cambios en el contenido de aminoácidos del arroz bajo estrés por NaCl. Aquí, evaluamos los perfiles de aminoácidos esenciales y no esenciales en plántulas de cuatro genotipos de arroz en presencia de tres tipos de sales, a saber, NaCl, CaCl y MgCl. Se determinaron los perfiles de aminoácidos en plántulas de arroz de 14 días. Los contenidos totales de aminoácidos esenciales y no esenciales en el cultivar Cheongcheong aumentaron considerablemente tras la aplicación de NaCl y MgCl, mientras que los aminoácidos totales aumentaron tras la aplicación de NaCl, CaCl y MgCl en el cultivar Nagdong. El contenido total de aminoácidos fue significativamente más bajo en el cultivar sensible a la sal IR28 y en el tolerante a la sal Pokkali bajo diferentes condiciones de estrés salino. La glicina no se detectó en ninguno de los genotipos de arroz. Observamos que los cultivares con el mismo origen responden de manera similar entre sí bajo condiciones de estrés por salinidad: se encontró que los cultivares Cheongcheong y Nagdong mostraban un aumento en el contenido total de aminoácidos, mientras que el contenido en los cultivares extranjeros IR28 y Pokkali disminuyó. Así, nuestros hallazgos mostraron que el perfil de aminoácidos de cada cultivar de arroz podría depender del origen, nivel de inmunidad y composición genética del respectivo cultivar.