Análisis a nivel genómico y perfil de expresión de la familia de genes de fosfolipasa D en
Autores: Li, Long; Zhang, Chao; Zhang, Mancang; Yang, Chenghui; Bao, Yanru; Wang, Dongdong; Chen, Qin; Chen, Yue
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Análisis a nivel genómico y perfil de expresión de la familia de genes de fosfolipasa D en
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Fosfolipasa d
Plantas
Estrés
Expresión génica
Estructura
Regulación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 23
Citaciones: Sin citaciones
La fosfolipasa D (PLD) es la hidrolasa de fosfolípidos más importante en las plantas, que puede hidrolizar fosfolípidos en ácido fosfatídico (PA) y colina. Cuando las plantas se enfrentan a bajas temperaturas, sequía y estrés por alta salinidad, la fosfolipasa D y sus productos juegan un papel importante en la regulación del crecimiento y desarrollo de las plantas y en la adaptación al estrés. En este estudio, se identificaron 16 miembros de la familia de genes StPLD en el genoma de la papa, que se distribuyeron en subfamilias alfa, beta y gamma, y se detectaron sus patrones de expresión bajo estrés por sal, alta temperatura, sequía y ABA mediante el método de qRT-PCR. El análisis de expresión génica mostró que la expresión de los genes StPLD en la papa se reguló al alza y a la baja en diferentes grados bajo los cuatro tipos de estrés, lo que indica que la familia de genes PLD está involucrada en la interacción de las hormonas de la planta de papa y las señales de estrés abiótico. La distribución cromosómica mostró que el gen StPLD estaba distribuido de manera desigual en 8 cromosomas, y solo se encontró un par de genes de repetición en tándem. Todos los promotores de StPLD contienen elementos cis-regulatorios relacionados con hormonas y estrés para responder a diferentes tipos de estrés. El análisis estructural mostró que los genes StPLD en el mismo subgrupo tenían una estructura similar de exones e intrones. Nuestro estudio proporciona una referencia valiosa para la investigación futura de la función y estructura del gen PLD.
Descripción
La fosfolipasa D (PLD) es la hidrolasa de fosfolípidos más importante en las plantas, que puede hidrolizar fosfolípidos en ácido fosfatídico (PA) y colina. Cuando las plantas se enfrentan a bajas temperaturas, sequía y estrés por alta salinidad, la fosfolipasa D y sus productos juegan un papel importante en la regulación del crecimiento y desarrollo de las plantas y en la adaptación al estrés. En este estudio, se identificaron 16 miembros de la familia de genes StPLD en el genoma de la papa, que se distribuyeron en subfamilias alfa, beta y gamma, y se detectaron sus patrones de expresión bajo estrés por sal, alta temperatura, sequía y ABA mediante el método de qRT-PCR. El análisis de expresión génica mostró que la expresión de los genes StPLD en la papa se reguló al alza y a la baja en diferentes grados bajo los cuatro tipos de estrés, lo que indica que la familia de genes PLD está involucrada en la interacción de las hormonas de la planta de papa y las señales de estrés abiótico. La distribución cromosómica mostró que el gen StPLD estaba distribuido de manera desigual en 8 cromosomas, y solo se encontró un par de genes de repetición en tándem. Todos los promotores de StPLD contienen elementos cis-regulatorios relacionados con hormonas y estrés para responder a diferentes tipos de estrés. El análisis estructural mostró que los genes StPLD en el mismo subgrupo tenían una estructura similar de exones e intrones. Nuestro estudio proporciona una referencia valiosa para la investigación futura de la función y estructura del gen PLD.