Análisis a nivel genómico y patrones de respuesta a estrés abiótico de la familia de genes en
Autores: Qiu, Chen; Chen, Jinhui; Wu, Weihuang; Liao, Bojun; Zheng, Xueyan; Li, Yong; Huang, Jing; Shi, Jisen; Hao, Zhaodong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis a nivel genómico y patrones de respuesta a estrés abiótico de la familia de genes en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Cobra
Gen
Celulosa
Expresión
Estrés
Frío
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
El gen COBRA codifica una proteína anclada a glicosilfosfatidilinositol (GPI) específica de plantas (GAP), que desempeña un papel importante en la deposición de celulosa en la pared celular. En este estudio, se identificaron un total de 7 genes en el genoma de la planta leñosa rara y en peligro de extinción. El análisis filogenético mostró que estos genes se pueden dividir en dos subfamilias, es decir, SF I y II. En el análisis de motivos conservados de las dos subfamilias, SF I contenía 10 motivos predichos, mientras que SF II contenía de 4 a 6 motivos. Los patrones de expresión específicos de tejidos mostraron que se expresó altamente en el floema y el xilema, lo que indica su posible papel en la biosíntesis de celulosa. Además, el análisis de elementos cis y los transcriptomas de estrés abiótico mostraron que tres genes respondieron transcripcionalmente a los estreses abióticos, incluyendo frío, sequía y estrés térmico. En particular, el análisis de PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) confirmó que el gen se reguló significativamente al alza en respuesta al estrés por frío y alcanzó su punto máximo a las 24-48 horas, lo que sugiere su posible papel en el mecanismo de resistencia al frío. Además, se encontró que LcCOBL2, LcCOBL4 y LcCOBL5 fusionados con GFP estaban localizados en la citomembrana. En resumen, esperamos que estos resultados sean beneficiosos para la investigación tanto de las funciones de los genes como del mejoramiento de la resistencia en esta planta.
Descripción
El gen COBRA codifica una proteína anclada a glicosilfosfatidilinositol (GPI) específica de plantas (GAP), que desempeña un papel importante en la deposición de celulosa en la pared celular. En este estudio, se identificaron un total de 7 genes en el genoma de la planta leñosa rara y en peligro de extinción. El análisis filogenético mostró que estos genes se pueden dividir en dos subfamilias, es decir, SF I y II. En el análisis de motivos conservados de las dos subfamilias, SF I contenía 10 motivos predichos, mientras que SF II contenía de 4 a 6 motivos. Los patrones de expresión específicos de tejidos mostraron que se expresó altamente en el floema y el xilema, lo que indica su posible papel en la biosíntesis de celulosa. Además, el análisis de elementos cis y los transcriptomas de estrés abiótico mostraron que tres genes respondieron transcripcionalmente a los estreses abióticos, incluyendo frío, sequía y estrés térmico. En particular, el análisis de PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) confirmó que el gen se reguló significativamente al alza en respuesta al estrés por frío y alcanzó su punto máximo a las 24-48 horas, lo que sugiere su posible papel en el mecanismo de resistencia al frío. Además, se encontró que LcCOBL2, LcCOBL4 y LcCOBL5 fusionados con GFP estaban localizados en la citomembrana. En resumen, esperamos que estos resultados sean beneficiosos para la investigación tanto de las funciones de los genes como del mejoramiento de la resistencia en esta planta.