La rápida urbanización está causando cambios en los espacios verdes y la conectividad ecológica. Hasta ahora, la investigación sobre ecosistemas urbanos se ha centrado principalmente en el uso de métricas de paisaje (LM) en un espacio bidimensional (2D). Nuestro estudio propone medidas tridimensionales (3D) de los bosques urbanos (UF) y cálculos de LM utilizando tecnología LiDAR. Primero, estimamos el volumen de UF de Cracovia (Polonia) y la distribución de la vegetación (baja, media, alta) utilizando un enfoque GEOBIA basado en voxeles, basado en la nube de puntos LiDAR ALS, imágenes satelitales y ortofotos aéreas en momentos específicos: 2006, 2012, 2017. Luego, se seleccionaron las métricas de paisaje apropiadas (NP, AREA_MN, CONTIG_MN, LPI, PARA_MN, SPLIT, MESH, PD, DIVISION, LSI) para cuantificar las diferencias entre las estructuras de vegetación derivadas de 2D y 3D y detectar cambios en el paisaje urbano. Los resultados mostraron que las áreas con baja vegetación disminuyeron debido a la expansión de las áreas construidas, mientras que las áreas con vegetación media y alta aumentaron en Cracovia entre 2006, 2012 y 2017. Hemos demostrado que la falta de información sobre las características verticales de la vegetación, es decir, el análisis de la vegetación en 2D, conduce a una sobreestimación de la conectividad del paisaje. En las clases de vegetación 3D, se observó que la vegetación baja estaba mejor conectada, seguida de la vegetación alta, mientras que la vegetación media estaba dispersa en el espacio de la ciudad. Estos resultados son particularmente relevantes para el entorno urbano, donde la distribución del espacio verde es crucial para la provisión de servicios ecosistémicos.