Las principales causas de mortalidad en los caballos son las patologías gastrointestinales asociadas con el shock séptico. Las células madre han demostrado, a través de la inyección sistémica, una capacidad para disminuir la inflamación y regenerar el tejido lesionado más rápidamente. Sin embargo, para lograr esta regeneración rápida y total, se debe considerar la inyección sistémica de 1 a 2 millones de células por kilogramo de peso corporal. Aquí, demostramos por primera vez la viabilidad y capacidad de expansión de las células estromales mesenquimales derivadas del músculo equino (mdMSCs) en un biorreactor de fibra hueca basado en perfusión, cerrado funcionalmente, automatizado, llamado Quantum(tm) Cell Expansion System (Terumo Blood and Cell Technologies). Esta característica aumenta significativamente el número de células generadas con una superficie de 1.7 m. La expansión de mdMSCs es muy eficiente en este biorreactor. La expansión máxima generó veinte veces más células que la siembra inicial en nueve días. Los mejores resultados se observaron con una siembra óptima entre 10 y 25 millones de mdMSCs, utilizando el método de carga de Bull"s eye y con una duración de ejecución entre 7 y 10 días. Además, todas las células generadas mantuvieron sus propiedades madre: la capacidad de adherirse al plástico y diferenciarse en condroblastos, osteoblastos y adipocitos. También mostraron la expresión de los marcadores CD-44 y CD-90, con una tasa positiva superior al 93%, mientras que CD-45 y MHCII no se expresaron, con una tasa positiva inferior al 0.5%. Al capitalizar la escalabilidad, automatización y capacidades de cultivo en 3D del Quantum(tm), es posible generar grandes cantidades de mdMSCs equinos de alta calidad para trastornos gastrointestinales y otras aplicaciones clínicas.