Este estudio investigó la co-existencia de bacterias patógenas humanas potenciales y amebas de vida libre en muestras recolectadas de agua almacenada en hogares rurales en Sudáfrica, utilizando agua de pozo como fuente principal de agua. Durante un período de 5 meses, se recolectaron y evaluaron un total de 398 muestras de agua almacenada y 392 muestras de biopelícula. Se identificaron amebas de vida libre microscópicamente en el 92.0% de las muestras de agua y en el 89.8% de las muestras de biopelícula. Una identificación molecular adicional utilizando secuenciación de 18S rRNA identificó spp., spp., spp. y spp., incluyendo el genotipo T4, que se sabe que es potencialmente dañino para los humanos. Se aislaron bacterias patógenas potenciales dirigidas de las muestras de agua utilizando métodos de cultivo estándar y se identificaron mediante secuenciación de 16S rRNA. Se identificaron spp., spp., spp. y otros patógenos oportunistas emergentes. Los resultados mostraron la importancia de realizar más estudios para evaluar el riesgo para la salud de las amebas de vida libre y las bacterias patógenas humanas potenciales para las personas que viven en comunidades rurales que no tienen otra opción que almacenar agua en sus hogares debido a la escasez de agua.