Los vehículos aéreos no tripulados (en adelante drones) están reemplazando rápidamente a las aeronaves tripuladas como la herramienta preferida para realizar censos aéreos de vida silvestre, pero quedan preguntas sobre cuáles protocolos de censo son más efectivos y menos impactantes en el comportamiento de la fauna. Evaluamos los efectos de los sobrevuelos de drones en especies no objetivo para informar el desarrollo de un censo del pato moteado de Florida (MODU; Anas fulvigula fulvigula). Nuestros objetivos fueron (1) evaluar el efecto de la altitud de vuelo en el comportamiento de las aves de los pantanos, (2) evaluar el efecto de la altitud en la capacidad de un censador para identificar las especies de aves detectadas, y (3) probar protocolos para los próximos censos de MODU. Volamos 120 transectos en movimiento continuo a altitudes que variaban de 12 a 91 m y modelamos variables que influían en la detección, identificación de especies y comportamiento de especies no objetivo. Pocas aves de los pantanos fueron perturbadas durante los vuelos de drones, pero no pudimos detectar aves con confianza en las dos altitudes más altas, y experimentamos dificultades para identificar las especies de aves detectadas en el video recopilado a 30 m. Nuestros hallazgos indican que los MODUs podrían ser censados a altitudes tan bajas como 12-30 m con un impacto mínimo en las aves de los pantanos adyacentes y que las especies de pantano no objetivo de mayor tamaño pueden ser identificadas a partir de videos recopilados durante los censos de drones de MODU.