El nitrato es uno de los contaminantes más comunes en aguas subterráneas en áreas rurales. En este trabajo, se ha estudiado la presencia de altos niveles de nitrato en las aguas subterráneas de los acuíferos de la parte oeste del Condado de la Hoya de Huesca (NE España) mediante la combinación de información hidrogeológica con técnicas de muestreo de agua a través de un amplio muestreo areal de 90 puntos de agua superficial y subterránea pertenecientes a varios acuíferos. Los resultados mostraron una hidroquímica general de aguas de carbonato de calcio a sulfato de calcio. A diferencia de otros estudios de caso en áreas mediterráneas, en los que la contaminación por nitrato estaba asociada con cultivos de regadío, las concentraciones más altas en el presente estudio se encontraron en áreas de secano donde se cultivan cereales de invierno. Un monitoreo mensual de los niveles de nitrato, realizado en 21 puntos seleccionados entre 2016 y 2017, mostró que el patrón de evolución del nitrato seguía los calendarios de aplicación de fertilizantes N en los puntos de muestreo en los que se registraron las concentraciones más altas, mientras que se podía observar una regularidad anual en los puntos de muestreo con bajos niveles de nitrato. La recopilación de datos de 16 puntos seleccionados desde 1990 muestra que el problema es persistente y apunta a la necesidad de implementar nuevas medidas de control de la contaminación de acuíferos, ya que las actualmente vigentes no han tenido éxito.