El objetivo de este estudio fue evaluar el efecto del ácido linoleico conjugado (CLA) en el tamaño de los glóbulos de grasa de la leche (MFG) y el microbioma ruminal de las cabras. Veinticuatro cabras lecheras Saanen en mitad de la lactancia, con un peso de 49 +/- 4.5 kg (168 +/- 27 d en leche, 1.2 +/- 0.1 kg de leche/día, de 2 a 3 años de edad) fueron divididas aleatoriamente en cuatro grupos: un grupo de control (CON), que recibió una dieta basal, y tres grupos de suplementación con CLA, en los que se añadieron 30 g de CLA (grupo de baja dosis, L-CLA), 60 g de CLA (grupo de dosis media, M-CLA) o 90 g de CLA (grupo de alta dosis, H-CLA) a la dieta basal diariamente. El experimento duró 21 días, durante los cuales se recolectó leche de cabra para el análisis de composición y tamaño de MFG. En el día 21 de la alimentación, se recolectó líquido ruminal de los grupos CON y H-CLA para analizar los cambios en la abundancia de microorganismos. Los resultados mostraron que la suplementación con CLA no afectó la producción de leche, la proteína de la leche o el contenido de lactosa en las cabras lecheras (> 0.05), pero redujo significativamente el contenido de grasa de la leche (< 0.01) en comparación con el grupo CON. La suplementación con CLA disminuyó significativamente el D y D de los MFG en una forma dependiente de la dosis (< 0.01). Además, la inclusión de CLA en la dieta aumentó la proporción de MFG de tamaño pequeño y disminuyó la de tamaño grande. Los resultados de la secuenciación del gen 16S rRNA mostraron que la depresión de grasa de la leche inducida por CLA en las cabras lecheras estuvo acompañada de cambios significativos en la abundancia relativa de poblaciones bacterianas ruminales, la mayoría de las cuales pertenecían a los filos Firmicutes y Bacteroidetes. La abundancia relativa de y en Bacteroidetes y , , y norank_f__norank_o__group en Firmicutes fue significativamente mayor en el grupo CON que en el grupo H-CLA. En contraste, la abundancia relativa de norank_f__, norank_f__group, unclassified_f__, y en Firmicutes y norank_f__ en Bacteroidetes fue significativamente mayor en el grupo H-CLA que en el grupo CON. El análisis de correlación mostró que el contenido de grasa de la leche estaba negativamente correlacionado con la abundancia relativa de algunas bacterias, incluidos miembros de Firmicutes y Bacteroidetes. De manera similar, el tamaño de MFG (D y D) estaba negativamente correlacionado con varios miembros de Firmicutes y Bacteroidetes, incluidos , norank_f__, , norank_f___group (Firmicutes), y norank_f__ (Bacteroidetes), mientras que estaba positivamente correlacionado con la abundancia relativa de algunos miembros de Firmicutes y Bacteroidetes, incluidos , , norank_f__norank_o__group, (Firmicutes), y group (Bacteroidetes). En general, nuestros datos indicaron que el tratamiento con CLA afectó el contenido de grasa de la leche y el tamaño de MFG en las cabras lecheras, y estos efectos estaban correlacionados con la abundancia relativa de poblaciones bacterianas ruminales. Estos resultados proporcionan la primera evidencia para explicar el mecanismo subyacente a la MFG inducida por la dieta desde la perspectiva del microbioma ruminal en las cabras lecheras.