Las alteraciones histopatológicas del hígado se han utilizado ampliamente como herramienta en estudios para el monitoreo de la calidad ambiental. Para evaluar la calidad ambiental en el río Cachoeira, se monitorearon cinco puntos entre los municipios de Itapé e Ilhéus mediante análisis histológico del hígado. La especie seleccionada para el análisis fue Poecilia vivipara debido a su abundancia en el muestreo. Se empleó la técnica habitual de inclusión e impregnación en parafina, y los cortes se tiñeron con hematoxilina y eosina (H&E). Las alteraciones histopatológicas del hígado se evaluaron semicuantitativamente y en función de la gravedad de las lesiones. Los resultados de la frecuencia de alteración histopatológica, junto con el promedio del Índice de Alteración Histopatológica de los puntos 1 (Vila de Itapé) y 2 (Fazenda Santa Amélia), mostraron que en esta zona el ambiente se encuentra más amenazado debido a algunos agentes estresantes, posiblemente contaminantes que parecen actuar en el ambiente y poner en peligro la salud de los peces. Los resultados estadísticos demostraron que no hubo diferencias significativas entre los puntos 1, 2 y 4, lo que significa que son muy similares entre sí y se encuentran en peligro ecológico.