Los objetivos para el ganado terminado a menudo se determinan por la grasa esperada, ya sea subcutánea o intramuscular. Estos objetivos se utilizan con frecuencia para mejorar la calidad de la carne. Menor grasa intramuscular, falta de uniformidad del producto y una ternura insuficiente pueden afectar negativamente la aceptabilidad de la carne de res. Este estudio tuvo como objetivo investigar las diferencias en la expresión génica que alteran el metabolismo y la señalización intercelular en el músculo y el tejido adiposo en las canales de carne de res en diferentes puntos finales de grasa. En este estudio, se recolectaron muestras del músculo longissimus thoracis y tejido adiposo en el momento de la cosecha, y se extrajo ARN que luego se secuenció utilizando RNAseq. La expresión diferencial se determinó utilizando edgeR, y los valores p se ajustaron utilizando el método de Benjamini-Hochberg. Un valor p corregido de 0.005 y un cambio logarítmico (fold change) de >1 fueron el umbral para identificar la expresión diferencial. La comparación entre la grasa intermuscular y subcutánea no mostró diferencias en los genes activados en los dos depósitos de tejido adiposo, lo que sugiere que la grasa subcutánea era una muestra adecuada. Los datos de la canal permitieron la clasificación de las canales según las calificaciones de calidad del USDA (objetivos de marmoleo). Al comparar el músculo de canales Standard y Choice, 15 genes fueron regulados a la baja y 20 fueron regulados al alza. Hubo 49 genes regulados a la baja y 113 regulados al alza al comparar el tejido adiposo de canales Standard y Choice. Estos genes están relacionados con el metabolismo de la grasa y la energía. Esto indica que la expresión de transcritos en el músculo varía menos que en el adiposo. Además, la grasa subcutánea puede usarse para evaluar los cambios en los transcritos de grasa. Sin embargo, no está claro si estos tejidos grasos pueden usarse como sustitutos para el marmoleo.