El selenio (Se) es crucial tanto para las plantas como para los humanos, siendo las plantas la principal fuente de ingesta de Se para los humanos. En las plantas, el Se moderado mejora el crecimiento y aumenta la resistencia al estrés, mientras que el exceso de Se conduce a la toxicidad. Los mecanismos fisiológicos por los cuales el Se influye en el crecimiento de las plántulas de arroz son poco comprendidos y requieren investigación adicional. Para estudiar los efectos del estrés por selenio en las plántulas de arroz, se utilizaron análisis de fenotipo de plantas, escaneo de raíces, determinación del contenido de iones metálicos, determinación del índice de respuesta fisiológica, determinación de niveles hormonales, PCR cuantitativa (qPCR) y otros métodos. Nuestros hallazgos indicaron que el selenito de sodio tenía efectos duales en el crecimiento de las plántulas de arroz en condiciones hidropónicas. A bajas concentraciones, el tratamiento con Se promueve el crecimiento de las plántulas de arroz al mejorar la biomasa, la longitud de las raíces y la capacidad antioxidante. Por el contrario, altas concentraciones de selenito de sodio perjudican y dañan el arroz, como lo evidencian el amarillamiento de las hojas, la reducción del contenido de clorofila, la disminución de la biomasa y el crecimiento atrofiado. Los niveles elevados de Se también afectan significativamente las actividades de antioxidasas y los niveles de prolina, malondialdehído, iones metálicos y varias fitohormonas, así como el metabolismo del selenio, el transporte de iones y los genes antioxidantes en el arroz. Los efectos adversos de altas concentraciones de Se pueden interrumpir directamente la síntesis de proteínas o inducir indirectamente estrés oxidativo al alterar la absorción y síntesis de otros compuestos. Este estudio tiene como objetivo elucidar las respuestas fisiológicas del arroz al estrés por toxicidad de Se y sentar las bases para el desarrollo de variedades de arroz enriquecidas con Se.